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r - 如何用 R 语言为不同的数据集编写函数方差分析？

问题描述

我想编写一个代码来执行方差分析，每次更改数据集或更改用于解析的变量时，我都不必更改代码。由于我的代码非常严格，因此只有一种类型的数据集。例如; 回答〜条件A的因子1 +因子2，但如果我将条件更改为B，C等。我想最初参数化以避免硬代码。如何使我的代码更实用、更不死板？

例子

input <- data.frame(
   order = gl(2,50, label = c(paste('area', LETTERS[1:2]))),
   f1 = gl(5,10, label = c(paste('conc', LETTERS[1:5]))),
   f2 = gl(5,2, label = c(paste('plot', LETTERS[1:5]))),
   f3 = factor(rep(paste("cond", 1:2, sep =""), 5)),
   values = abs(rnorm(100))
   )

model <- by(input,input$order, function(x){
   f1 = levels(factor(x$f1))
   f2 = levels(factor(x$f2))
   f3 = levels(factor(x$f3))
   order = levels(factor(x$order))

     for( i in (1: length(f1))){
        for(j in (1: length(order))){

        di <- x[x$f1 == f1[i] & x$order == order[j] ,]

        write(paste('\nf1:', "f1", f1[i],order[j],'\n'), stderr())
        anova.1 <- aov(values ~ f2 * f3, di)

        print(summary(anova.1))
        }
        } 
        write("Analyse Finished! \n", stderr())  
       })

标签： rloopsanova

解决方案

对于处理中的任何动态元素，只需将其存储为数据点。因此，请考虑将您的不同公式直接保存在相应的数据框中：

input <- data.frame(
   order = gl(2,50, label = c(paste('area', LETTERS[1:2]))),
   f1 = gl(5,10, label = c(paste('conc', LETTERS[1:5]))),
   f2 = gl(5,2, label = c(paste('plot', LETTERS[1:5]))),
   f3 = factor(rep(paste0("cond", 1:2), 5)),                 # USE paste0 WHEN sep=""
   values = abs(rnorm(100)),
   aov_formula = "values ~ f2 * f3",                         # NEW SCALAR COLUMN
   stringsAsFactors = FALSE                                  # AVOID STRING TO FACTORS
)

input
#    order     f1     f2    f3    values      aov_formula
# 1 area A conc A plot A cond1 0.3673828 values ~ f2 * f3
# 2 area A conc A plot A cond2 1.5170873 values ~ f2 * f3
# 3 area A conc A plot B cond1 1.0677476 values ~ f2 * f3
# 4 area A conc A plot B cond2 1.7239528 values ~ f2 * f3
# 5 area A conc A plot C cond1 0.3247375 values ~ f2 * f3
# 6 area A conc A plot C cond2 0.7483484 values ~ f2 * f3

model <- by(input,input$order, function(x){
     ...
     anova.1 <- aov(as.formula(x$aov_formula[1]), di)        # STRING-FORMULA CONVERSION
     ...
})

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