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python - Cython 无法识别 pymalloc Python

问题描述

我有一个 conda 环境，它在使用 Cython 时出现错误。我无法在不让 bug 消失的情况下减少依赖列表，所以这里是完整的环境：

# environment.yml
name: test
channels:
  - conda-forge
  - defaults
dependencies:
  - pip
  - compilers
  - make
  - setuptools
  - cython
  - daetk
  - hdf5 =*=*mpich*
  - h5py =*=*mpich*
  - metis
  - mpich
  - numpy
  - openblas
  - parmetis
  - petsc4py
  - petsc
  - python=3
  - scorec
  - superlu
  - superlu_dist
  - triangle
  - pychrono
  - mpi4py
  - gmsh
  - matplotlib
  - mpi4py
  - nose
  - pytables
  - pytest
  - pytest-cov
  - pytest-xdist
  - scipy
  - tetgen
  - ncurses
  - pychrono
  - python=3
  - future
  - ipyparallel
  - pillow
  - recordtype

创建环境：conda env create -f environment.yml

激活它：conda activate test

创建一个文件helloworld.pyx：

print("Hello World")

创建一个setup.py：

from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize

setup(
    ext_modules = cythonize("helloworld.pyx")
)

Cythonize它：python setup.py build_ext --inplace

使用 导入时python -c "import helloworld"，会出现以下错误：

Traceback (most recent call last):
  File "<string>", line 1, in <module>
ModuleNotFoundError: No module named 'helloworld'

它创建了一个文件helloworld.cpython-37-x86_64-linux-gnu.so，它应该在的位置helloworld.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so。事实上，如果你重命名它，你可以验证它是否正常工作：

mv helloworld.cpython-37-x86_64-linux-gnu.so helloworld.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so

在 conda 环境中m存在后缀：$CONDA_PREFIX/include/python3.7m. 我知道这与 Python 是否用 pymalloc 编译有关，但我不明白为什么 Cython 在这种情况下看不到它。

标签： pythoncythondistutilsconda-forge

解决方案

它实际上是由 conda-forge 中的 Python 3.7.6 构建损坏引起的。它已被修复。

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