r - 尝试在 R 中重新排列表格。（我是初学者！）是否有某种“转置”功能？

Question

我正在尝试重新排列 R 中的表格。

我有（例如）52 只狮子。在 4 个时间点采集的血液样本中，对每只狮子的 92 种不同标记进行了测量。目前，我有一个狮子 ID 列，它有 208 行长，因为它排列在“样本编号”列旁边，表示它所采用的时间点，时间 1、2、3、4。然后是来自 92 种不同标记的血液样本的值。所以总共 94 列（ID、样本编号和标记类型）。

查看数据：

'ID' 'Sample Number' 'Marker type'
-Lion 1 time 1 Marker 1 Marker 2 Marker 3...Marker 92 
-Lion 1 time 2 Marker 1 Marker 2 Marker 3...Marker 92
-Lion 1 time 3 Marker 1 Marker 2 Marker 3...Marker 92
-Lion 1 time 4 Marker 1 Marker 2 Marker 3...Marker 92
-Lion 2 time 1 Marker 1 Marker 2 Marker 3...Marker 92
-Lion 2 time 2 Marker 1 Marker 2 Marker 3...Marker 92
-Lion 2 time 3 Marker 1 Marker 2 Marker 3...Marker 92
-Lion 2 time 4 Marker 1 Marker 2 Marker 3...Marker 92
-Lion 3 time 1 Marker 1 Marker 2 Marker 3...Marker 92
-Lion 3 time 2 Marker 1 Marker 2 Marker 3...Marker 92
-Lion 3 time 3 Marker 1 Marker 2 Marker 3...Marker 92
-Lion 3 time 4 Marker 1 Marker 2 Marker 3...Marker 92

我需要对其进行更改，以便它为我提供 52 个狮子 ID 的列（而不是每只狮子 4 行），然后为每个 92 个标记提供 4 列样本编号，总共提供 369 列。

预期输出数据：

'ID' 'Sample Number' 'Marker type'    
 lion 1 time 1 marker 1 time 2 marker 1 time 3 marker 1 time 4 marker 1
 lion 2 time 1 marker 2 time 2 marker 2 time 3 marker 2 time 4 marker 2
 lion 3 time 1 marker 3 time 2 marker 3 time 3 marker 3 time 4 marker 3

我不是特别想为时间 1 标记 1 创建一个新变量，而是为标记 1 设置一列，分成 4 列时间，其中 1 行用于狮子。标记 2 也是如此，依此类推。

标签： r

Answer 1

我想我们可以pivot_wider在这里使用：

tidyr::pivot_wider(df, names_from = Samp_Num, values_from = Mark1:Mark3))
#OR
#tidyr::pivot_wider(df, names_from = Samp_Num, values_from = starts_with("Mark"))

# A tibble: 3 x 13
#  ID    Mark1_time1 Mark1_time2 Mark1_time3 Mark1_time4 Mark2_time1 Mark2_time2
#  <fct> <fct>       <fct>       <fct>       <fct>       <fct>       <fct>      
#1 Lion1 Marker1     Marker1     Marker1     Marker1     Marker2     Marker2    
#2 Lion2 Marker1     Marker1     Marker1     Marker1     Marker2     Marker2    
#3 Lion3 Marker1     Marker1     Marker1     Marker1     Marker2     Marker2    
# … with 6 more variables: Mark2_time3 <fct>, Mark2_time4 <fct>,
#   Mark3_time1 <fct>, Mark3_time2 <fct>, Mark3_time3 <fct>, Mark3_time4 <fct>

在我的示例数据中，我们有 3 个标记列，现在我们在最终输出中有 13 个列（每次 3 * 4 + 1）。同样，对于您的实际数据，您应该有 369 列 (92 * 4 + 1)。

数据

创建了一个小样本数据

df <- structure(list(ID = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 
3L, 3L, 3L, 3L), .Label = c("Lion1", "Lion2", "Lion3"), class = "factor"), 
Samp_Num = structure(c(1L, 2L, 3L, 4L, 1L, 2L, 3L, 4L, 1L, 
2L, 3L, 4L), .Label = c("time1", "time2", "time3", "time4"
), class = "factor"), Mark1 = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "Marker1", class = "factor"), 
Mark2 = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
1L, 1L), .Label = "Marker2", class = "factor"), Mark3 = structure(c(1L, 
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "Marker3", class = "factor")),
class = "data.frame", row.names = c(NA, -12L))