r - 密码子和数字

Question

每个男孩。我是 R 的初学者。我想问一下您如何将密码子分配给数字我的意思是： AAA 是 1 AAC 是 2 AAG 是 3 AAT 或 AAU 是 4 。. . 而随后。感谢大家

标签： rnumbersgenetic

Answer 1

像这样的东西？

BASES = c("A","C","G","T")
triN = apply(expand.grid(BASES,BASES,BASES),1,paste,collapse="")
data.frame(number=1:length(triN),codon=sort(triN))

   number codon
1       1   AAA
2       2   AAC
3       3   AAG
4       4   AAT
5       5   ACA
6       6   ACC
7       7   ACG
8       8   ACT
9       9   AGA
10     10   AGC
11     11   AGG
12     12   AGT