pyiron - 在 HPC 集群中运行 Vasp 作业

Question

使用 pyiron，我构建了我的脚本并将其提交到集群中运行，我想知道我该怎么做？

注意：Vasp 已经安装在我的集群中。

标签： pyiron

Answer 1

pyiron 使用 pysqa 将作业提交到队列系统： https ://github.com/pyiron/pysqa 示例队列配置位于： https ://github.com/pyiron/pysqa/tree/master/tests/config 所以在您的 pyiron 资源目录您创建一个名为的文件夹queues，其中包含 pysqa 排队系统配置。

完成后，您可以使用：

job.server.list_queues()

查看可用队列并：

job.server.view_queues()

获取有关单个队列的更多信息，并最终使用以下方式提交作业：

job.server.queue = 'queue_name'

queue_name您要选择的队列的名称在哪里，然后指定cores并run_time使用：

job.server.cores = 8 
job.server.run_time = 30000

最后，当您调用job.run()它时，它会自动提交到队列中。