r - 有没有办法使用存在/不存在数据计算多个站点之间的差异梯度？

Question

我一直在尝试根据存在或不存在数据为每个湖泊的值为 1 或 0 的系列中的鱼类提出物种（不）相似性的度量标准。根据我的研究，使用 Jaccard 索引的多站点差异指数似乎效果最好，因为每个湖的单站点存在/不存在不需要嵌套或特殊的营业额警告。通过 'betapart' 计算 R 中的 beta 多样性的度量得出的总体值为 0.86。现在我想为每个站点提供一个 (dis)similarity 的值，然后我可以用它作为连续变量插入 RDA。是否有计算特定站点差异的方法？我能想到的最接近的方法是在所有地点取 β 多样性 =0.86，然后计算每个湖泊中存在的物种数量除以 0.86，有点使用临时的 Jaccard 指数公式。例如站点 1 将是 =(1/7)/0.86；虽然我不知道这是否违反任何假设。以下是我使用的数据。

        Species1 Species2 Species3 Species4 Species5 Species6 Species7
Site 1      1       0         0       0         0        0       0
Site 2      1       1         0       0         0        0       1
Site 3      1       1         1       1         1        1       1
Site 4      1       0         0       0         0        0       0
Site 5      1       0         0       0         0        0       1
Site 6      1       0         0       0         0        0       0
Site 7      1       0         1       0         0        0       0
Site 8      1       0         0       0         0        0       0
Site 9      1       0         0       0         0        0       0

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