c++ - 使用带有 Rcpp 的 C++ 类从 C 或 R 修改它
问题描述
我开始使用 rcpp,我想创建一个对象,我可以在其中修改来自 R 或 rcpp 的变量。似乎创建一个类在某种程度上是一个很好的解决方案,因为我可以使用 R 中的“$”修改字段,或者直接使用 Rcpp 函数。我的问题是,当我尝试使用类方法从 rcpp 修改我的类的变量时,R 只是崩溃了......
下面是一个小例子。该类包含一些不同类型的变量,加上一个构造函数和两个函数,一个用于打印值(用于测试我做某事时是否真的完成了更改),一个用于更改该类的变量。
library(Rcpp)
library(RcppArmadillo)
# ODEs can also be described using Rcpp
Rcpp::sourceCpp(code = '
#include <Rcpp.h>
//#include <RcppArmadillo.h>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
class parameters{
public:
NumericMatrix mat;
double val;
int n;
NumericVector dB;
parameters(double x):
val(x) {}
NumericVector changes(){
dB[0] = val;
dB[1] = 12;
//dB[1] = mean(mat(1,_));
}
void print(){
Rcout << "val:" << std::endl << val << std::endl;
Rcout << "mat:" << std::endl << mat << std::endl;
}
};
RCPP_MODULE(ParamModule){
using namespace Rcpp;
class_<parameters>("parameters")
.constructor<double>("constructor")
.method("changes", ¶meters::changes)
.method("print", ¶meters::print)
.field("val", ¶meters::val)
.field("mat", ¶meters::mat)
.field("n", ¶meters::n)
.field("dB", ¶meters::dB)
;
}
// [[Rcpp::export]]
NumericMatrix addVal(NumericMatrix mat, double val, int n){
int i = 0;
for (i=0; i<n; i++){
mat(i, 1) = mat(i,1) + val;
}
return mat;
}
')
这是我用来测试它的代码:
p = new(parameters,5)
str(p) # constructor initialise the field val, ok
p$mat = matrix(5, nrow = 5, ncol = 5)
p$print() # field mat initialised, ok
p$mat = matrix(0.1, nrow = 5, ncol = 5)
p$print() # field mat changed, ok
addVal(p$mat, 2, 5)
p$print() # sounds like p is a pointer, ok
p$changes() #...
最后一行是问题发生的地方(没有错误消息,因为 R 只是崩溃了)。
当我编译这个类时,我有这个警告:
Warning message:
No function found for Rcpp::export attribute at file215bf0ef501.cpp:8
另外,我在这里看到我可能需要使用这两行:
ParamModule = Module("ParamModule")
parameters = ParamModule$parameters
但是当我运行最后一个时我收到一条错误消息:
Error in Module(module, mustStart = TRUE) :
Failed to initialize module pointer: Error in FUN(X[[i]], ...): no such symbol _rcpp_module_boot_ParamModule in package .GlobalEnv
(ParamModule 作为全局环境中的环境存在)。
所以,我的问题是:
1) 为什么函数 p$changes() 不起作用
2) 我需要加载 paramModule 吗?好像什么都改变不了...
谢谢!
解决方案
支持通过您发现的 Rcpp 模块公开 C++ 类。
同样在包中,不太知名,但由 John Chambers 自己添加的是 Rcpp 类,它是 Rcpp 模块的扩展,这似乎正是您所要求的。
在Rcpp 作为完整目录和 test 附带的完整示例包中的示例。包中还有文档。