首页 > 解决方案 > 使用带有 Rcpp 的 C++ 类从 C 或 R 修改它

问题描述

我开始使用 rcpp,我想创建一个对象,我可以在其中修改来自 R 或 rcpp 的变量。似乎创建一个类在某种程度上是一个很好的解决方案,因为我可以使用 R 中的“$”修改字段,或者直接使用 Rcpp 函数。我的问题是,当我尝试使用类方法从 rcpp 修改我的类的变量时,R 只是崩溃了......

下面是一个小例子。该类包含一些不同类型的变量,加上一个构造函数和两个函数,一个用于打印值(用于测试我做某事时是否真的完成了更改),一个用于更改该类的变量。

library(Rcpp)
library(RcppArmadillo)

# ODEs can also be described using Rcpp
Rcpp::sourceCpp(code = '

#include <Rcpp.h>
//#include <RcppArmadillo.h>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
class parameters{
public:
  NumericMatrix mat;
  double val;
  int n;
  NumericVector dB;

  parameters(double x):
    val(x) {}

  NumericVector changes(){
    dB[0] = val;
    dB[1] = 12;
    //dB[1] = mean(mat(1,_));
  } 

  void print(){
    Rcout << "val:"  << std::endl << val << std::endl;
    Rcout << "mat:"  << std::endl << mat << std::endl;
  }
};

RCPP_MODULE(ParamModule){
using namespace Rcpp;
  class_<parameters>("parameters")

  .constructor<double>("constructor")

  .method("changes", &parameters::changes)
  .method("print", &parameters::print)

  .field("val", &parameters::val)
  .field("mat", &parameters::mat)
  .field("n", &parameters::n)
  .field("dB", &parameters::dB)
  ;  
}

// [[Rcpp::export]]
NumericMatrix addVal(NumericMatrix mat, double val, int n){
  int i = 0;
  for (i=0; i<n; i++){
    mat(i, 1) = mat(i,1) + val;
  }

  return mat;
}


')

这是我用来测试它的代码:

p = new(parameters,5)
str(p) # constructor initialise the field val, ok
p$mat = matrix(5, nrow = 5, ncol = 5)
p$print()  # field mat initialised, ok
p$mat = matrix(0.1, nrow = 5, ncol = 5)
p$print()  # field mat changed, ok
addVal(p$mat, 2, 5)
p$print() # sounds like p is a pointer, ok
p$changes() #...

最后一行是问题发生的地方(没有错误消息,因为 R 只是崩溃了)。

当我编译这个类时,我有这个警告:

Warning message:
No function found for Rcpp::export attribute at file215bf0ef501.cpp:8 

另外,我在这里看到我可能需要使用这两行:

ParamModule = Module("ParamModule")
parameters = ParamModule$parameters

但是当我运行最后一个时我收到一条错误消息:

Error in Module(module, mustStart = TRUE) : 
  Failed to initialize module pointer: Error in FUN(X[[i]], ...): no such symbol _rcpp_module_boot_ParamModule in package .GlobalEnv

(ParamModule 作为全局环境中的环境存在)。

所以,我的问题是:

1) 为什么函数 p$changes() 不起作用

2) 我需要加载 paramModule 吗?好像什么都改变不了...

谢谢!

标签: c++rrcpp

解决方案


支持通过您发现的 Rcpp 模块公开 C++ 类。

同样在包中,不太知名,但由 John Chambers 自己添加的是 Rcpp 类,它是 Rcpp 模块的扩展,这似乎正是您所要求的

Rcpp 作为完整目录和 test 附带的完整示例包中的示例。包中还有文档。


推荐阅读