ubuntu - Cytoscape 3.7.2 在 Ubuntu 19.10 中不起作用
问题描述
从 升级Ubuntu 18.04
到后Ubuntu 19.10
,我无法打开以前的.cys
文件或使用Cytoscape 3.7.2
. 这是脚本检查器的结果。它让我知道Cytoscape 3.7.2
并且Ubuntu 19.10
不兼容,这似乎是一个 Java 问题。有没有人试图解决这个问题?谢谢
解决方案
我刚刚在 Cytoscape 帮助台上回答了这个问题。为了完整起见,这是我的建议:
- 尝试从某个地方安装 Java 8 的副本。我们在 Linux 上使用 OpenJDK 8 的经验有些参差不齐,但除了使用 JavaFX 之外,它似乎还可以工作。
- 将您的 Java 更新到 OpenJDK 11 并尝试使用 Cytoscape 3.8 候选版本。有一些已知的错误,所以这不会是最终版本,但它确实适用于大多数事情。您可以在此处找到候选版本: https ://cytoscape-builds.ucsd.edu/cytoscape-builds/Cytoscape-3.8.0/3.8.0-Release-Candidate-2/
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