r - 广义相异模型（gdm）的输入格式

Question

我正在使用gdm包，并在 formatsitepair 命令中使用格式 1 和 4 对 bioData 进行了尝试。但结果不同，如下所示：

格式 1：逐个物种矩阵

逐物种矩阵

gdm_input1 <- formatsitepair(bioData = bio1, bioFormat = 1, dist = "jaccard", abundance = FALSE, siteColumn = "site", XColumn = "longitude", YColumn = "latitude", predData = env)

结果 1格式站点对：

结果格式1

格式 4：站点距离表

站点距离表

gdm_input4 <- formatsitepair(bioData = bio4, bioFormat = 4, dist = "jaccard", abundance = FALSE, siteColumn = "site", XColumn = "longitude", YColumn = "latitude", predData = env)

结果 2格式站点对：

它显示与我的输入数据框相同的数据框 -站点距离表

我不明白为什么这不起作用。

标签： renvironment-variablesdistancesimilaritymixed-models

Answer 1

原因是格式 4 不仅需要一个站点的一个值，还需要每个站点与每个其他站点的所有可能的站点对组合！