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python - 使用 HDF5 库和 h5py 模块的交替错误

问题描述

我创建了一个 CNN 模型并尝试将其保存为 .h5 文件，然后加载模型。我在 Anaconda 的虚拟环境中工作。有趣的是，我可以在虚拟环境中的 Jupyter Notebook 中毫无问题地做任何事情。但是，当我尝试在终端中运行它（加载模型，然后评估它）时，它不起作用。我有一组交替错误，这些错误在网络上有解决方案，但这些解决方案要么导致死胡同，要么导致其他错误。

第一个错误：

Traceback (most recent call last):
  File "MNIST.py", line 64, in <module>
    main()
  File "MNIST.py", line 62, in main
    evaluate_model()
  File "MNIST.py", line 54, in evaluate_model
    model = models.load_model('final_model.h5')
  File "C:\Users\Josh Cruz\Documents\.conda\envs\tensorflow\lib\site-packages\keras\engine\saving.py", line 492, in load_wrapper
    return load_function(*args, **kwargs)
  File "C:\Users\Josh Cruz\Documents\.conda\envs\tensorflow\lib\site-packages\keras\engine\saving.py", line 582, in load_model
    if H5Dict.is_supported_type(filepath):
  File "C:\Users\Josh Cruz\Documents\.conda\envs\tensorflow\lib\site-packages\keras\utils\io_utils.py", line 209, in is_supported_type
    isinstance(path, h5py.Group) or
AttributeError: module 'h5py' has no attribute 'Group'

我还没有找到特定的修复方法Attribute Error: module 'h5py' has no attribute 'Group'，但我确实在网上找到了类似的问题，其解决方案建议我应该使用conda install -c conda-forge h5py. 这对我来说很有意义，因为组似乎是 2.10.0 h5py 文档的一部分。

安装后出现：

The following packages will be downloaded:

package                    |            build
---------------------------|-----------------
h5py-2.9.0                 |nompi_py36h9dfa0df_1103         909 KB  conda-forge
------------------------------------------------------------
                                       Total:         909 KB

The following NEW packages will be INSTALLED:

  h5py               conda-forge/win-64::h5py-2.9.0-nompi_py36h9dfa0df_1103

The following packages will be SUPERSEDED by a higher-priority channel:

  certifi              pkgs/main::certifi-2019.11.28-py36_1 --> conda-forge::certifi-2019.11.28- 
py36h9f0ad1d_1

我很困惑，因为我以为我安装的是 2.10.0 版本。我还是安装了，尝试重新运行我的程序并得到一个全新的错误：

Headers are 1.10.4, library is 1.10.5
        SUMMARY OF THE HDF5 CONFIGURATION
        =================================

General Information:
-------------------
               HDF5 Version: 1.10.5
              Configured on: 2019-03-04
              Configured by: Visual Studio 14 2015 Win64
                Host system: Windows-10.0.17763
          Uname information: Windows
                   Byte sex: little-endian
         Installation point: C:/Program Files/HDF5

为了篇幅，我没有包括整个错误，但整个错误可以在这个问题中找到。建议是 to do pip install h5py --upgrade --no-dependencies --force，但这样做会导致同样的错误。另一个来源（我现在找不到）说，在同时安装 pip 和 conda 时可能存在问题，所以我运行pip uninstall h5py了，但错误仍然存​​在。然后，使用此处的建议，我运行conda install -c anaconda hdf5=1.10.4以使库与标头匹配。我被困在这里，因为即使我再次运行我的程序，我仍然会得到同样的错误。我不明白为什么，图书馆现在不应该是 1.10.4 吗？

然后其他地方都建议我卸载，然后重新安装。如果我卸载，我会收到我写下的第一个错误。当我重新安装时，循环再次开始。任何帮助，将不胜感激。

标签： pythontensorflowanacondahdf5h5py

解决方案

您是否已经尝试在此 使用hdf5=1.10.5conda install -c anaconda hdf5=1.10.5而不是使用hdf5=1.10.4 运行？

您在 conda 环境中安装了 1.10.4 hdf5 库，Tensorflow 的某些依赖项具有更新的 hdf5 1.10.5 头文件。

尝试将您的 conda hdf5 库更新到较新的 1.10.5或使用以下命令：

set HDF5_DISABLE_VERSION_CHECK=2

这应该禁用警告，但不提供正确执行的任何保证，因此最好将 hdf5库更新到相同的版本 1.10.5。

如果这还不够，请尝试以下解决方法：

首先，尝试删除 h5py 2.10.0 版本的更新将其恢复为原始版本并

通过以下方式将 hdf5 升级到 1.10.5 版本：

conda install -c anaconda hdf5=1.10.5

并通过以下方式卸载 h5py 的双重安装（如果您安装了双重 h5py）：

conda uninstall h5py
pip uninstall h5py

如果你只有一个然后卸载它

最后，再次升级到 hdf5 2.10.0 版本

conda install -c conda-forge h5py

我希望这有帮助。

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