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php - 从 PHP 运行 RMarkdown

问题描述

我正在尝试使用exec()命令从 PHP 运行 RMarkdown。尝试编织我的 .Rmd 文件时，我收到以下错误：

Execution haltedArray ( 
[0] => Error in with_pandoc_safe_environment(system(paste(shQuote(path), "--version"), : 
[1] => The 'HOME' environment variable must be set before running Pandoc. 
[2] => Calls: <Anonymous> ... FUN -> get_pandoc_version -> with_pandoc_safe_environment 
[3] => Execution halted )

该命令Rscript -e "rmarkdown::render('path/to/file.Rmd')"在命令行上运行良好。

标签： phpcommand-liner-markdownpandoc

解决方案

它在那里说出了什么问题：它需要HOME设置一个环境变量。不确定您的环境是什么，但您可以在命令按预期工作的 shell 中找到它的值：

echo $HOME

然后将该值添加到您的exec()调用中：

exec("HOME=/the/path/you/got/before $theRMarkdownCommandYouNeed")

或者您可能需要另一个路径，特定于您运行 PHP 的用户。

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