python - 如何在熊猫中绘制类似“眼图”的图？

问题描述

我有一堆类似的曲线，例如 1000 个幅度、频率和相位略有不同的正弦波，它们看起来像这个图：

在上图中，每个正弦波的颜色来自标准 pandas 颜色图；我想得到一个颜色与曲线的“密度”相关的图。

我的第一个想法是模仿旧的示波器屏幕（搜索“持久模式”或查看https://en.wikipedia.org/wiki/Eye_pattern了解一些背景）：

所以我为所有曲线设置了一种颜色：

但情节“平坦”，“密度”信息不太好。

我真的很想要这样的情节：

在上图中，黄色表示 25 到 30 之间的多条曲线“通过”同一点（或同一像素）。我手工制作了上面的情节，我想问是否可以用 pandas 或 matplotlib 做得更好、更直接。

上面的数字是用这个程序制作的，因为 Bresenham 的线算法没有优化，所以需要一段时间（十几或几秒钟）。

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd

np.random.seed(0)

# Code adapted from "Eye Diagram" by WarrenWeckesser at https://scipy-cookbook.readthedocs.io/items/EyeDiagram.html
def bres_segment_count_slow(x0, y0, x1, y1, grid):
    """Bresenham's algorithm.

    The value of grid[x,y] is incremented for each x,y
    in the line from (x0,y0) up to but not including (x1, y1).
    """

    if np.any(np.isnan([x0,y0,x1,y1])):
        return    

    nrows, ncols = grid.shape

    dx = abs(x1 - x0)
    dy = abs(y1 - y0)

    sx = 0
    if x0 < x1:
        sx = 1
    else:
        sx = -1
    sy = 0
    if y0 < y1:
        sy = 1
    else:
        sy = -1

    err = dx - dy

    while True:
        # Note: this test is moved before setting
        # the value, so we don't set the last point.
        if x0 == x1 and y0 == y1:
            break

        if 0 <= x0 < nrows and 0 <= y0 < ncols:
            grid[int(x0), int(y0)] += 1

        e2 = 2 * err
        if e2 > -dy:
            err -= dy
            x0 += sx
        if e2 < dx:
            err += dx
            y0 += sy

def bres_curve_count_slow(y, x, grid):
    for k in range(x.size - 1):
        x0 = x[k]
        y0 = y[k]
        x1 = x[k+1]
        y1 = y[k+1]
        bres_segment_count_slow(x0, y0, x1, y1, grid)

def linear_scale(x,src_min,src_max,dst_min,dst_max):
    return dst_min+(x-src_min)*(dst_max-dst_min)/(src_max-src_min)


grid_W = 1358
grid_H = 892
grid = np.zeros((grid_H, grid_W), dtype=np.int32)

t = np.linspace(-np.pi, np.pi, 201)

ys = []

for i in range(0,1000):
    ys.append(np.random.normal(loc=1,scale=.05)*np.sin(np.random.normal(loc=1,scale=.01)*t+np.random.normal(loc=0,scale=.15)))

df = pd.DataFrame(ys).transpose()

fig, ax = plt.subplots(1)
df.plot(legend=False,ax=ax)
ax.figure.savefig('pandas.png',bbox_inches='tight', dpi=300)

fig, ax = plt.subplots(1)
df.plot(legend=False,ax=ax,color='#b6ffea')
ax.set_facecolor('#4b4f2c')
ax.figure.savefig('pandas_m.png',bbox_inches='tight', dpi=300)


tmin = np.nanmin(t)
tmax = np.nanmax(t)

ymin = np.nanmin(ys)
ymax = np.nanmax(ys)

t_d = np.round(linear_scale(t,tmin,tmax,0,grid_W))

ys_d = []
for y in ys:
    ys_d.append(np.round(linear_scale(y,ymin,ymax,0,grid_H)))

for yd in ys_d:
    bres_curve_count_slow(t_d, yd, grid)

plt.figure()
grid = grid.astype(np.float32)
grid[grid==0] = np.nan
plt.imshow(grid,origin='lower',cmap=plt.cm.hot)
ax = plt.gca()
ax.set_facecolor('k')
plt.colorbar()
plt.savefig("hand_made_persistence.png", bbox_inches='tight', dpi=300)

标签： pythonpandasmatplotlibline-drawing

Matplotlibhist2d非常有效地计算了分箱。该参数可以设置两个方向bins的 bin 数量。xy

用细线绘制曲线并使用小的 alpha 值组合它们是另一种方法。

from matplotlib import pyplot as plt
import numpy as np

t = np.linspace(-np.pi, np.pi, 200)
ys = [np.random.normal(1, .05) * np.sin(np.random.normal(1, .01) * t + np.random.normal(0, .15))
      for i in range(0, 1000)]
fig, axs = plt.subplots(nrows=3, sharex=True)
axs[0].plot(t, np.array(ys).T)
axs[1].plot(t, np.array(ys).T, color='crimson', alpha=.1, lw=.1)
axs[2].hist2d(np.tile(t, len(ys)), np.ravel(ys), bins=(200, 50), cmap='inferno')
plt.show()

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解决方案

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