r - R 中的圆形堆叠条形图 - 美学长度必须为 1 或与数据相同 (26)
问题描述
我正在尝试创建一个圆形堆叠条形图,如此处所述(https://www.r-graph-gallery.com/299-circular-stacked-barplot.html)。当我进入制作情节的步骤时出现以下错误(下面以粗体显示):
错误:美学长度必须为 1 或与数据相同 (26):只需运行rlang::last_error()
即可查看错误发生的位置。另外:警告消息:删除了包含缺失值的 208 行 (position_stack)。
这是我的数据的样子(有 5 列和 70 行):
个人; 团体; 值1;值2;值3;价值4
这是我的代码:
以整齐的格式(长格式)转换数据
data <- data %>% gather(key = "observation", value="value", -c(1,2))
制作情节
p <- ggplot(data) +
geom_bar(aes(x=as.factor(id), y=value, fill=observation), stat="identity", alpha=0.5) +
scale_fill_viridis(discrete=TRUE) +
geom_segment(data=grid_data, aes(x = end, y = 0, xend = start, yend = 0), colour = "grey", alpha=1, size=0.3 , inherit.aes = FALSE ) +
geom_segment(data=grid_data, aes(x = end, y = 2, xend = start, yend = 2), colour = "grey", alpha=1, size=0.3 , inherit.aes = FALSE ) +
geom_segment(data=grid_data, aes(x = end, y = 4, xend = start, yend = 4), colour = "grey", alpha=1, size=0.3 , inherit.aes = FALSE ) +
geom_segment(data=grid_data, aes(x = end, y = 6, xend = start, yend = 6), colour = "grey", alpha=1, size=0.3 , inherit.aes = FALSE ) +
geom_segment(data=grid_data, aes(x = end, y = 8, xend = start, yend = 8), colour = "grey", alpha=1, size=0.3 , inherit.aes = FALSE ) +
ggplot2::annotate("text", x = rep(max(data$id),5), y = c(0, 2, 4, 6, 8), label = c("0", "2", "4", "6", "8") , color="grey", size=6 , angle=0, fontface="bold", hjust=1) +
ylim(-150,max(label_data$tot, na.rm=T)) +
theme_minimal() +
theme(
legend.position = "none",
axis.text = element_blank(),
axis.title = element_blank(),
panel.grid = element_blank(),
plot.margin = unit(rep(-1,4), "cm")
) +
coord_polar() +
geom_text(data=label_data, aes(x=id, y=tot+10, label=individual, hjust=hjust), color="black", fontface="bold",alpha=0.6, size=5, angle= label_data$angle, inherit.aes = FALSE ) +
geom_segment(data=base_data, aes(x = start, y = -5, xend = end, yend = -5), colour = "black", alpha=0.8, size=0.6 , inherit.aes = FALSE ) +
geom_text(data=base_data, aes(x = title, y = -18, label=group), hjust=c(1,1,0,0), colour = "black", alpha=0.8, size=4, fontface="bold", inherit.aes = FALSE)
**ggsave(p, file="output1.png", width=10, height=10)**
我将不胜感激。
谢谢!!
个人组 价值1 价值2 价值3 价值4
Biomarker1 Group1 0 1 2 2
Biomarker2 Group2 0 1 0 2
Biomarker3 Group2 0 1 0 1
Biomarker4 Group3 1 2 1 0
Biomarker5 Group4 0 2 4 1
Biomarker6 Group4 0 1 0 1
Biomarker7 Group4 0 1 0 1
Biomarker8 Group5 0 1 0 1
Biomarker9 Group6 0 1 1 1
Biomarker10 Group6 0 2 1 1
解决方案
这里有很多问题。前两个是严肃的并且关注“hard_coding”的使用。也就是说,代码不依赖于数据。后两个是您的数据的小问题,而不是代码。
hjust
论据:geom_text(data=base_data, aes(...), hjust=c(1,1,0,0), ...
- y 轴范围:
ylim(-150, max(label_data$tot, na.rm=T))
- 数据高度倾斜。
- 你有太多的酒吧和太多的团体。
数字 1 导致错误:
# Error: Aesthetics must be either length 1 or the same as the data (24): hjust
# Run `rlang::last_error()` to see where the error occurred.
在链接的帖子中,base_data
看起来像这样:
# A tibble: 4 x 4
group start end title
<chr> <int> <dbl> <dbl>
1 A 1 8 4.5
2 B 11 38 24.5
3 C 41 52 46.5
4 D 55 58 56.5
但是对于您的数据,它看起来像这样:
# A tibble: 24 x 4
group start end title
<chr> <int> <dbl> <dbl>
1 Group1 1 -1 0
2 Group10 2 1 1.5
3 Group11 4 5 4.5
4 Group12 8 8 8
5 Group13 11 9 10
6 Group14 12 42 27
7 Group15 45 43 44
8 Group16 46 47 46.5
9 Group17 50 49 49.5
10 Group18 52 52 52
# ... with 14 more rows
因此,hjust
需要将参数更改为取决于数据的内容,而不是使用值进行硬编码。也许只是省略它并查看图表的外观并在需要时更改它。
2 号并不严重,但会导致您的图表在中心有一个大洞。-150 的值是基于数据的,所以这(硬编码)是不好的做法。看起来最小 y 轴值应该更改为-max(label_data$tot, na.rm=T)
,现在更通用了。但这可能需要一些修补才能获得最佳结果。理想值还可能取决于条形的数量和数据的偏度。
还有其他部分也使用了硬编码。
3 号并不严重,但会导致一些标签出现在绘图区域之外。您可以尝试转换 y 轴,但我将由您决定。
4号也不严重,但会导致内圈内的标签重叠。
修复这些和其他小问题后,您应该得到以下信息:
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