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r - 重复 data.table fread 和 fwrite 导致“权限被拒绝”错误

问题描述

data.table fwrite()我使用and函数在并行计算中管理资源时遇到了这个问题fread()，但也能够在下面的顺序示例代码中重新创建行为。调用fwrite()会引发以下错误：

fwrite(dt, csv_path) 中的错误：权限被拒绝：'D:/mypath/test.csv'。无法打开现有文件进行写入。你有写权限吗？这是 Windows 吗？ Excel 等其他进程是否已打开它？

该行为似乎与fread()之前的调用有关，因为注释掉该fread()命令会使错误消失。根据您的系统，您可能必须在错误发生之前增加迭代次数，因为它发生在不同的迭代次数上。

有谁知道为什么会这样？提前感谢你的帮助！

示例代码：

library(data.table)

dt = data.table(a = c(1, 2), b = c("a", "b"))
csv_path = "D:/mypath/test.csv"
fwrite(dt, csv_path)

for(i in 1:10000){
  test = fread(csv_path)
  fwrite(dt, csv_path)
}

系统信息

R 版本 4.0.0 (2020-04-24)

平台：x86_64-w64-mingw32/x64（64位）

运行于：Windows Server x64（内部版本 14393）

data.table_1.12.8

标签： rdata.tablepermission-deniedr-4.0.0

解决方案

我在 Windows 机器上尝试了您的代码，但无法重现它。

我相信这个问题与 Windows 文件处理程序有关，它似乎不够快，无法在再次打开文件连接之前关闭它。

您可以尝试以下代码以查看它是否仅在 R 中可重现：

x = "a,b\n1,a\n2,b\n"

csv_path = "D:/mypath/test.csv"
file.create(csv_path)
f = file(csv_path, "w")
cat(x, file=f)
close(f)

for (i in 1:10000) {
  f = file(csv_path, "r")
  test = readLines(f)
  close(f)
  f = file(csv_path, "w")
  cat(x, file=f)
  close(f)
}

还有一点是有意义的，那就是看看有多少Sys.sleep足以让问题消失。

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