weka - 将 Weka Fiji 插件分段导出为 ROI
问题描述
我正在使用 Imagej/Fiji Weka 插件对图像的不同区域进行分类,我想获得这些区域以进行进一步处理……(作为 Rois?带有类的表?)
所以最后我想获得每个分段类的区域。我需要编写这个任务的脚本,因为它是管道的一部分......但不知道如何从 Weka Imagej 插件中提取结果......</p>
实际上这个代码示例只是为了说明这个想法。任何人都有一个关于应用分类器和导出结果的基本示例?先感谢您
import trainableSegmentation.*;
import ij.IJ;
import ij.ImagePlus;
// input train image
input = IJ.openImage( someImage.jpg" );
// create Weka Segmentation object
segmentator = new WekaSegmentation( input );
// load classifier from file
segmentator.loadClassifier( "classifier.model" );
result = segmentator.applyClassifier( input );
...
解决方案
您在 image.sc 论坛中对此有几个答案:https ://forum.image.sc/t/measuring-area-fraction-in-a-weka-classifed-image/7979 https://forum。 image.sc/t/quantifing-weka-output/4660/6
话虽如此,您也可以直接使用生成的标签图像在其他插件中进行测量,例如来自 MorphoLibJ 的插件(安装后,在 Plugins > MorphoLibJ > Analyze 下)。
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