r - 根据数据子集的汇总统计重新排序因子

Question

我正在尝试从我的数据框的子集中重新排序一个因子，该因子由另一个使用forcats::fct_reorder().

考虑以下数据框df：

set.seed(12)
df <- data.frame(fct1 = as.factor(rep(c("A", "B", 'C'), each = 200)),
             fct2 = as.factor(rep(c("j", "k"), each = 100)), 
             val = c(rnorm(100, 2), # A - j
                     rnorm(100, 1), # A - k
                     rnorm(100, 1), # B - j
                     rnorm(100, 6), # B - k
                     rnorm(100, 8), # C - j
                     rnorm(100, 4)))# C - k

我想使用ggridges包绘制多面组密度。例如：

ggplot(data = df, aes(y = fct2, x = val)) +
    stat_density_ridges(geom = "density_ridges_gradient",
                        calc_ecdf = T, 
                        quantile_fun = median, 
                        quantile_lines = T) +
    facet_wrap(~fct1, ncol = 1) 

我现在想按每个方面上密度值的fct1中位数（默认为）排序，即 where 。因此，此示例中的目标是分面以 B - C - A 的顺序出现。这似乎与此处的问题非常相似，不同之处在于我不想先汇总数据，因为我需要原始数据绘制密度。fct_reorder()fct2 == "k"

我试图在链接问题的答案中调整代码：

df <- df %>% mutate(fct1 = forcats::fct_reorder(fct1, filter(., fct2 == 'k') %>% pull(val)))

但它返回以下错误：

forcats::fct_reorder(fct1, filter(., fct2 == "k") %>% pull(val)) 中的错误：

长度（f）==长度（.x）不正确

很明显，它们的长度不同，但我不太明白为什么这个错误是必要的。我的猜测是，通常不能保证fct1子集中存在所有级别的 ，这肯定是有问题的。但是，在我的示例中并非如此。有没有办法解决这个错误，或者我做错了什么？

我知道我可以用几行额外的代码来解决这个问题，例如，创建子集数据的辅助变量，重新排序，然后将级别顺序作为我在原始数据集中的因素。我仍然想要一个更漂亮的解决方案，因为我经常面临同样的任务。

标签： rdplyrforcatsridgeline-plot

Answer 1

你可以用一个小辅助函数来做到这一点：

f <- function(i) -median(df$val[df$fct2 == "k" & df$fct1 == df$fct1[i]])

这使您可以像这样重新排序：

df$fct1 <- forcats::fct_reorder(df$fct1, sapply(seq(nrow(df)), f))

这给了你这个情节：

ggplot(data = df, aes(y = fct2, x = val)) +
    stat_density_ridges(geom = "density_ridges_gradient",
                        calc_ecdf = T, 
                        quantile_fun = median, 
                        quantile_lines = T) +
    facet_wrap(~fct1, ncol = 1)