首页 > 解决方案 > R, drc 包的 drm() 函数显示负山坡。即使图表描述为增加特征

问题描述

我曾经通过 GraphPad Prism 分析结果。这些天我尝试使用 R & drc 包进行分析。

当我尝试 drm(...., fct.LL4()) 时,我发现山坡(b 因子)是负值,即使图形在增加。

令人惊讶的是,GraphPad Prism 向我显示了与 drc 相同的图的正山坡。

有人说drm的山坡是种相对价值,所以只抓价值的管理。

但在生物领域,山坡是非常重要的因素,因为它暗示着药物的作用。

那么,我能得到建议,为什么 drc 包被设计来表达负山坡?

标签: rdrmdrc

解决方案


drc包使用四参数逻辑曲线的以下参数化:

在此处输入图像描述

当 时,这条曲线正在减小b > 0

f <- function(x, b, c, d, e){
  c + (d-c)/(1+exp(b*(log(x)-log(e))))
}
x <- seq(1, 10, by = 0.1)
y <- f(x, b=20, c=0, d=2, e=5)
plot(x, y, type = "l")

在此处输入图像描述

如果您习惯于b在曲线增加时获得正值,那是因为参数化不同。


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