axis - ggplot2 - y 值之间具有大空间的连续 x 尺度：我想分散 x 值以更好地可视化 y

Question

这对我来说有点难以解释，所以请多多包涵。我正在可视化甲基化数据（EPIC 阵列），其中包含映射到基因组的探针。这些探针有时密集，有时稀疏。

我想在 x 上显示基因组位置，在 y 上显示甲基化值。为了查看探针与特定基因的关系，我正在制作一个轨迹图（图 1）。正如您所看到的，在两个点簇中间没有数据的情况下存在很大差距。我想更好地展示这些点，将它们展开，如图 2 所示。但是，我不能将 x 作为因子，因为它会破坏轨迹图中基因的比例（它们必须对齐）。我想知道是否有办法删除图中的这个空间，或者用可见的中断替换它，表明 ggplot 中的比例是不连续的？我知道 facet_zoom，但这对我来说并不真正适用于轨迹图。

我的数据框：

头(df)

剧情代码：

ggplot(df, aes(x = as.numeric(pos), y = beta, col = timepoint)) +
  geom_jitter(width = 0.2, size = 3, alpha = 0.6) +
  labs(title = "CpGs", x = "Chromosome position", y = "Beta value", col = "Day" )+
  scale_color_brewer(palette="PRGn") +
  theme(axis.text.x = element_text(angle = 45)) +
  stat_summary(aes(y = beta, group = timepoint), fun = mean, geom = "line")

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