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python - 创建 hdf5 文件时始终出现权限错误

问题描述

我有以下代码段来创建一个 hdf5 文件，并使用“with”语句来确保文件正确关闭。但是，我仍然收到如下错误消息。

   filename = 'E30.hdf5'
   try:
        with h5py.File(filename, 'w-') as f:
            print('---')
    except: 
        os.remove(filename)
        f = h5py.File(filename, 'w-')

但是，我仍然收到如下错误消息。在工作目录中，可能已经有一个名为“E30.hdf5”的现有文件。但这真的重要吗？我试图直接从Windows中删除它。但是，Windows 不允许我删除它说它正在打开。

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OSError                                   Traceback (most recent call last)
<ipython-input-6-e8ccfbc1b5d2> in vid_to_hdf(En, start, end, chunk)
      9     try:
---> 10         with h5py.File(filename, 'w-') as f:
     11             print('---')

~\AppData\Local\Continuum\anaconda3\envs\fastai-py37\lib\site-packages\h5py\_hl\files.py in __init__(self, name, mode, driver, libver, userblock_size, swmr, rdcc_nslots, rdcc_nbytes, rdcc_w0, track_order, **kwds)
    407                                fapl, fcpl=make_fcpl(track_order=track_order),
--> 408                                swmr=swmr)
    409 

~\AppData\Local\Continuum\anaconda3\envs\fastai-py37\lib\site-packages\h5py\_hl\files.py in make_fid(name, mode, userblock_size, fapl, fcpl, swmr)
    176     elif mode in ['w-', 'x']:
--> 177         fid = h5f.create(name, h5f.ACC_EXCL, fapl=fapl, fcpl=fcpl)
    178     elif mode == 'w':

h5py\_objects.pyx in h5py._objects.with_phil.wrapper()

h5py\_objects.pyx in h5py._objects.with_phil.wrapper()

h5py\h5f.pyx in h5py.h5f.create()

OSError: Unable to create file (unable to open file: name = 'E30.hdf5', errno = 17, error message = 'File exists', flags = 15, o_flags = 502)

During handling of the above exception, another exception occurred:

PermissionError                           Traceback (most recent call last)
<timed eval> in <module>

<ipython-input-6-e8ccfbc1b5d2> in vid_to_hdf(En, start, end, chunk)
     11             print('---')
     12     except:
---> 13         os.remove(filename)
     14         f = h5py.File(filename, 'w-')
     15     # Create dataset within file

PermissionError: [WinError 32] The process cannot access the file because it is being used by another process: 'E30.hdf5'

标签： pythonpython-3.xhdf5h5py

解决方案

您一次遇到多个问题。首先，让我们从h5py.File()access_mode 标志开始。

  • w-：创建文件，如果存在则失败（避免意外覆盖现有文件）
  • w：创建文件，如果存在则截断（意味着它会覆盖现有文件）
  • r+：读/写，文件必须存在（用于打开现有文件写入数据）。

在下面的逻辑中，如果不存在，您的try:/except:模式将执行该try:语句。如果存在，它将执行该语句。E30.hdf5 except:E30.hdf5

这是通过不同的方法复杂化的，h5py.File()是每个分支。您的try:分支使用该with h5py.File() as f:方法。因此，当您的代码执行此逻辑时，文件将在最后干净地关闭（没有f.close()语句）。

但是，您的except:分支使用f=h5py.File(). 因此，当您的代码执行此逻辑时，您需要一个f.close()语句来确保最后关闭。

这是我认为您正在经历的场景：

  1. 我假设E30.hdf5您第一次运行代码时不存在。
  2. 因此，第一次运行时，您会经过try:分支，最后会干净地关闭文件。
  3. 下次运行代码时，E30.hdf5存在，所以，你通过except:分支。因此，文件不会在进程结束时关闭，并且另一个进程无法访问它（Python 或操作系统）。

编码建议：

您的except:块具有相同的行为mode=w。下面的代码行为相同，并且总是在进程完成时关闭文件。此外，它更具可读性（恕我直言）。注意：E30.hdf5如果存在，两种方法都会删除。

filename = 'E30.hdf5'
with h5py.File(filename, 'w') as f: # use mode=w
     print('---')

如果迫切需要保持try:/except:模式，请进行此更改：（try:/except:用于访问模式w-并且r+没有os.remove(filename).）

filename = 'E30.hdf5'
try:
    with h5py.File(filename, 'w-') as f:
        print('---')
except: 
    os.remove(filename)
    with h5py.File(filename, 'w-') as f:
         print('+++')

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