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r - knitr在渲染时没有正确采购项目.Rprofile

问题描述

我有一个设置了 .Rprofile 的 Rstudio 项目，其中包含

library(tidyverse)
library(knitr)
knitr::opts_chunk$set(cache.path='cache/', fig.path='figures/')

当我渲染成 html 时，我在子目录中单独有一个 .Rmd 文件。但是，在我直接使用 .Rprofile 获取它之前，似乎根本没有获取它source(here('.Rprofile'))。我确实知道它在控制台中正确获取，并且我希望 knitr 渲染过程将其获取到（无需我直接执行）。到底是怎么回事？谢谢！

标签： rr-markdownknitr

解决方案

当您单击 Rstudio 中的 knit 按钮时，它会启动一个单独的 R 会话来编译文档（源），并且此过程发生在 .Rmd 文件所在的目录中。如果该目录不是您的项目根目录（即您的 .Rprofile 所在的位置），则 .Rprofile 的来源不正确。要获取它，请将其添加到 .Rmd 的顶部：

source("../.Rprofile", chdir = TRUE)

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