r - 在 R 中变换和可视化相似度矩阵

Question

我正在使用一个包含多个条目及其相似性的矩阵，格式如下：

//      A      B      C  

 A      1     0.8    0.4

 B      0.8    1     0.2

 C      0.4   0.2     1

在这种情况下，1 表示两个条目相同，0 表示它们完全不同。每个条目代表一串观察结果，这些观察结果要么存在，要么不存在。通过检查重叠观察来计算相似度值。我想可视化不同条目的这种关系；在这种情况下可以使用树状图吗？

标签： rmatrixvisualizationsimilarity

Answer 1

这里有两种可视化矩阵的方法。

1. 关联图

   图书馆（corrplot）
   corrplot（垫）

2. 树状图使用hclust

您的矩阵是相似的，但是对于hclust，我们需要不相似，所以我将使用 1 - Mat 对其进行转换。

HC = hclust(as.dist(1-Mat))
plot(HC)