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c++ - 使用#include未能检查 R 包

问题描述

我正在用 C++ 为 R 构建一个包。如何在代码中包含库？例如，如果我使用#include <vector>向量，R 检查会失败并出现错误

> fatal error: vector: No such file or directory
> E>  #include <vector>
> E>           ^~~~~~~~
> E> compilation terminated.

如另一个答案中所述，我已尝试LinkingTo: vector在说明文件中使用，但它不起作用。

标签： c++rrcppr-package

解决方案

最近添加的题为“使用外部库创建 R 包的 13 个简单步骤”的小插图涵盖了您所要求的主题。

非常广泛地，可以有三种类型的带有外部库的包：

  • 仅标头，这很容易，因为您只需要处理-I...标志
  • 嵌入式，这很容易，因为小库可以包含在包中
  • 外部用于可能较大的库，这是最难的变体

外部库是最难的，因为 R 非常便携的特性让您担心如何在 Windows、macOS 和不同的 Linux 风格上使用该库进行构建。

说了这么多，这里你的问题一定是更根本的。我们不能说太多，因为您没有提供MCVE，但很容易证明 Rcpp当然知道 STL 向量类在哪里（初始代码是一行，此处仅用于说明）

R> Rcpp::cppFunction("std::vector<int> doubleMe(std::vector<int> x) { \
      std::vector<int> y(x.size()); for (size_t i=0; i<x.size(); i++) \
           y[i] = x[i]+x[i]; return y; }")
R> doubleMe(1:3)
[1] 2 4 6
R>

这清楚地表明 Rcpp 知道在哪里可以找到头文件——所以你要么在计算机上以某种非常不寻常的方式安装了编译器和库，或者 R，要么以错误的方式调用 R。有关 Rcpp的更多详细信息，请参阅Rcpp 简介。

PS 对于 Rcpp 类型，它只是

R> Rcpp::cppFunction("IntegerVector doubleMe(IntegerVector x) { return x+x; }")
R> doubleMe(2:4)
[1] 4 6 8
R>

PPS 当然，你也可以在没有 Rcpp的情况下完成所有这些操作，如何做到这一点在（在这种情况下为必读）编写 R 扩展手册中有描述。在我的谈话页面上，我有几个（较旧的）教程的链接，这些教程从十年前开始，其中显示了示例。因为这实际上很麻烦，所以我会推荐 Rcpp。

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