r - 使用多个变量/参数在 R 中可视化“corrplot”
问题描述
我正在使用作为包的corrplot
一部分的函数来可视化我拥有的数据通道之间的相关性。我的问题是我是否可以将两个“因素”或参数分配给圆圈......所以,例如,我可以让圆圈的大小代表相关性,而圆圈的颜色代表其他东西,例如滞后?我的数据实际上是互相关数据,我已经确定了最大相关/滞后,并且希望能够在图中将两者可视化,这就是我想要这样做的原因。corrplot
R
基本上我想要实现的与这个问题相同:R:使用 corrplot 使用圆圈的大小和颜色来可视化两个变量(例如,相关性和 p 值),但是,这两种解决方案都不适用于我和我从 Github 安装软件包时遇到错误。
我有一个滞后和相关的向量:
CCO_lag = (0, NaN , -2 , NaN , -5 , -4 , -6 , -3 , 0 , NaN , 1 , 3 , NaN , 0 , -3 , NaN)
CCO_r = c(-0.4757 , NaN , 0.5679 , NaN , 0.5582 , 0.5899 , 0.5857 , 0.6256 , -0.4646 , NaN , -0.6286 , -0.4699 , NaN , -0.7710 , 0.5869 , NaN `)
假设我想在一个1x16
正方形中将其可视化,corrplot
我希望圆圈的大小取决于 in 的相关值,CCO_r
而圆圈的颜色取决于 in 的滞后值CCO_lag
。
任何人都可以帮忙吗?
谢谢!
解决方案
这对我来说似乎不太像相关图,但我们可以这样做:
CCO_lag = c(0, NaN , -2 , NaN , -5 , -4 , -6 , -3 , 0 , NaN , 1 , 3 , NaN , 0 , -3 , NaN)
CCO_r = c(-0.4757 , NaN , 0.5679 , NaN , 0.5582 , 0.5899 , 0.5857 , 0.6256 , -0.4646 , NaN , -0.6286 , -0.4699 , NaN , -0.7710 , 0.5869 , NaN )
d = data.frame(id = 1:length(CCO_lag), CCO_lag, CCO_r)
ggplot(d, aes(x = id, y = "A", size = CCO_r, color = CCO_lag)) +
geom_point() +
scale_y_discrete(breaks = NULL) +
labs(y = "", x = "")
如果你有矩阵:
lag_mat = matrix(CCO_lag, 4)
r_mat = matrix(CCO_r, 4)
row = c(row(lag_mat))
col = c(col(lag_mat))
dd = data.frame(
lag = c(lag_mat), r = c(r_mat), row, col
)
ggplot(dd, aes(x = row, y = col, size = r, color = lag)) +
geom_point() +
theme(panel.grid = element_blank())
请注意,矩阵的顶部是第 1 行,下面是编号较高的行,但图的底部是较低的 y 值,上面是编号较高的 y 值。你可能想改变它,或者它可能没问题。您可以添加scale_y_reverse()
到您的情节以切换它。
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