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python - pyspark 中的 Pandas UDF

问题描述

我正在尝试对 spark 数据框进行一系列观察。基本上我有一个日期列表，我应该为每个组创建缺少的一个。
在 pandas 中reindex，有 pyspark 中没有的功能。
我试图实现一个熊猫 UDF：

@pandas_udf(schema, functionType=PandasUDFType.GROUPED_MAP)
def reindex_by_date(df):
    df = df.set_index('dates')
    dates = pd.date_range(df.index.min(), df.index.max())
    return df.reindex(dates, fill_value=0).ffill()

这看起来应该做我需要的，但是它失败了这个消息 AttributeError: Can only use .dt accessor with datetimelike values 。我在这里做错了什么？
这里是完整的代码：

data = spark.createDataFrame(
        [(1, "2020-01-01", 0), 
        (1, "2020-01-03", 42), 
        (2, "2020-01-01", -1), 
        (2, "2020-01-03", -2)],
        ('id', 'dates', 'value'))

data = data.withColumn('dates', col('dates').cast("date"))

schema = StructType([
     StructField('id', IntegerType()),
     StructField('dates', DateType()),
     StructField('value', DoubleType())])

@pandas_udf(schema, functionType=PandasUDFType.GROUPED_MAP)
def reindex_by_date(df):
     df = df.set_index('dates')
     dates = pd.date_range(df.index.min(), df.index.max())
     return df.reindex(dates, fill_value=0).ffill()

data = data.groupby('id').apply(reindex_by_date)

理想情况下，我想要这样的东西：

+---+----------+-----+                                                          
| id|     dates|value|
+---+----------+-----+
|  1|2020-01-01|    0|
|  1|2020-01-02|    0|
|  1|2020-01-03|   42|
|  2|2020-01-01|   -1|
|  2|2020-01-02|    0|
|  2|2020-01-03|   -2|
+---+----------+-----+

标签： pythonpandasapache-sparkpyspark

解决方案

案例 1：每个 ID 都有一个单独的日期范围。

我会尽量减少 udf 的内容。在这种情况下，我只会计算 udf 中每个 ID 的日期范围。对于其他部分，我将使用 Spark 原生函数。

from pyspark.sql import types as T
from pyspark.sql import functions as F

# Get min and max date per ID
date_ranges = data.groupby('id').agg(F.min('dates').alias('date_min'), F.max('dates').alias('date_max'))

# Calculate the date range for each ID
@F.udf(returnType=T.ArrayType(T.DateType()))
def get_date_range(date_min, date_max):
  return [t.date() for t in list(pd.date_range(date_min, date_max))]

# To get one row per potential date, we need to explode the UDF output
date_ranges = date_ranges.withColumn(
  'dates',
  F.explode(get_date_range(F.col('date_min'), F.col('date_max')))
)

date_ranges = date_ranges.drop('date_min', 'date_max')

# Add the value for existing entries and add 0 for others
result = date_ranges.join(
  data,
  ['id', 'dates'],
  'left'
)

result = result.fillna({'value': 0})

案例 2：所有 id 具有相同的日期范围

我认为这里没有必要使用 UDF。您想要的内容可以以不同的方式存档：首先，您可以获得所有可能的 ID 和所有必要的日期。其次，你交叉加入它们，这将为你提供所有可能的组合。第三，将原始数据左连接到组合上。第四，将出现的空值替换为 0。

# Get all unique ids
ids_df = data.select('id').distinct()

# Get the date series
date_min, date_max = data.agg(F.min('dates'), F.max('dates')).collect()[0]
dates = [[t.date()] for t in list(pd.date_range(date_min, date_max))]
dates_df = spark.createDataFrame(data=dates, schema="dates:date")

# Calculate all combinations
all_comdinations = ids_df.crossJoin(dates_df)

# Add the value column
result = all_comdinations.join(
  data,
  ['id', 'dates'],
  'left'
)

# Replace all null values with 0
result = result.fillna({'value': 0})

请注意此解决方案的以下限制：

  1. 交叉连接可能非常昂贵。可以在这个相关问题中找到解决该问题的一种潜在解决方案。
  2. 收集语句和 Pandas 的使用导致了不完全并行化的 Spark 转换。

[编辑] 分为两种情况，因为我首先认为所有 ID 都具有相同的日期范围。

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