首页 > 解决方案 > 计算时bash中的变量错误

问题描述

我将管道的输出分配给一个变量,但是当我尝试使用该变量进行数学运算时,它不允许我:

%%bash
cd /data/ref/
grep -v ">" EN | wc -c > ref
cat ref
cd /example/
grep -v ">" SR | wc -l > sample
cat sample

echo $((x= cat sample, y= cat ref, u=x/y, z=u*100))

我收到此错误:

41858
38986
bash: line 7: x= cat sample, y= cat ref, u=x/y, z=u*100: syntax error in expression (error token is "sample, y= cat ref, u=x/y, z=u*100"

标签: bashpipesyntax-errorvariable-assignmentcommand-substitution

解决方案


您收到该错误是因为您将无效的算术表达式传递到 bash算术扩展中。这个地方只允许使用算术表达式。您尝试做的事情看起来像这样:

ref="$(grep -v ">" /data/ref/EN | wc -c)"
sample="$(grep -v ">" /example/SR | wc -l)"

# this is only integer division
#u=$(( sample / ref ))
#z=$(( 100 * u ))

# to do math calculations, you can use bc
u=$(bc <<< "scale=2; $sample/$ref")
z=$(bc <<< "scale=2; 100*$u")

printf "%d, %d, %.2f, %.2f\n" "$ref" "$sample" "$u" "$z"

所以希望你得到这样的输出:

41858, 38986, 0.93, 93.00

笔记:

  • 在执行之前不需要cda grep,它接受带有目标文件名的完整路径作为参数。因此,无需更改目录,您就可以在grep不同的位置。

  • 为了保存命令的输出(这只是一个数字),您不需要将其保存在文件和cat文件中。只需使用语法var=$( )并将var分配此命令替换的输出。

  • 请记住,/除法将导致 0,38986/41858因为它是整数除法。如果您想使用小数进行数学计算,您可以查看这篇文章,了解如何使用bc.

  • 要打印任何内容,请使用内置的 shell printf。这里最后两个数字用 2 个小数点格式化。


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