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linux - 如何在使用 awk 不匹配时添加行结果“non_assigned”？

问题描述

当我在输入文件 (input.txt) 的一行上运行命令 (COMMAND) 时，我会得到一个相关的结果，其中只有一行是有趣的，总是从世界门开始。

例如：

superkingdom    2759    Eukaryota
clade   554915  Amoebozoa
phylum  555280  Discosea
order   313555  Himatismenida
family  313556  Cochliopodiidae

所以我跑：

for p in $(cat input.txt)
    do COMMAND $p | grep "\bphylum\b" >> results.txt
done

为了在我的文件 result.txt 中包含所有行，例如：

phylum  555280  Discosea

但是，有时 grep 没有结果（没有以 phylum 开头的行），并且它不会在 results.txt 中添加任何行。例如，我想为这些特定情况添加一些带有“0”或“未分配”的行（因此 input.txt 的每一行都与 results.txt 匹配）。

clade   2696291 Ochrophyta
class   5747    Eustigmatophyceae
order   425074  Eustigmatales
family  425072  Monodopsidaceae

我已经尝试添加 | awk print '{print $0"non_assigned"}' ，不成功。

你有什么想法可以帮助我吗？一位成员建议我使用 awk '/phylum/{print $0}!/phylum/{print "non_assigned";exit} 但即使存在门结果，我也会得到输出“non_assigned”。

标签： linuxbashawk

解决方案

像这样？：

$ grep phylum file || echo "non assigned"

在文件中找到门时输出：

phylum  555280  Discosea

当没有找到时：

non assigned

在 awk 中相同：

$ awk '/phylum/&&found=1;END{if(!found)print "non assigned"}'

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