首页 > 解决方案 > 使用 aicspylibczi 打开 .czi 文件(蔡司显微镜文件)平铺时出现问题

问题描述

我正在尝试使用 aicspylibczi 打开平铺(马赛克).czi 文件,但收到以下错误消息:“坐标被过度指定 = 您指定了无效的 Dimension 或 Dimension 值。场景索引 -1 ∉ [0, 0)"。

我的代码只是:

import aicspylibczi
img_tile = path+"JM200718_1_Out.czi"
execute_czi = aicspylibczi.CziFile(img_tile)

,我没有指定任何坐标,因为我可以毫无问题地打开具有 300 z 和 2 个通道的 .czi 文件,但只有一个 xy 开始坐标(不是马赛克文件),我觉得问题在于我的图像是马赛克文件。有没有人知道如何解决这个问题?这是我的代码的第一步,所以我一直在尝试看看这里有什么问题。我找到的所有示例,包括马赛克文件的特定示例都是我写的(女巫不工作)。例如:https ://pypi.org/project/aicspylibczi/

感谢您花时间阅读我!

标签: coordinatesdimensions

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