python - 如何使用 OpenMP 以并行模式在图形工具包中运行 SBM 算法？

Question

我一直在使用在图形工具包中实现的SBM 算法。我需要处理大量数据并且需要并行运行。

我知道 OpenMP 在这个包中默认是激活的，并且在特定和兼容的算法中使用，但是文档没有指定哪些算法。

我试过openmp_enabled()or openmp_set_num_threads()and also export OMP_NUM_THREADS=16。一切似乎都很好，但是当我检查正在运行的进程时，它不是并行的。

您有实施 SBM 并行化的经验吗？

标签： pythonopenmpgraph-tool

Answer 1

尽管 graph-tool 使用 OpenMP，但并不是每个算法都是并行实现的，因为在某些情况下无法做到这一点。graph-tool中实现的SBM推理算法是基于MCMC的，一般不能并行化。因此，启用 OpenMP 将不起作用。