snakemake - 访问尝试计数器以更改工作行为

Question

我有一项工作可能会因特定配置而失败，我想做的是让它运行一次，如果失败则运行稍微不同的配置。我找到了尝试参数，但我没有找到在资源标签之外访问它的方法......

您知道如何访问它或任何替代方法吗？

标签： snakemake

Answer 1

尝试计数器包含在作业脚本的参数“'--attempt''int'”中（在我的情况下是python中的包装脚本）

因此，您可以通过以下方式访问它：

sys.argv[sys.argv.index('--attempt')+1]