python - 没有合并的堆叠条形图的问题

Question

我很清楚我想绘制什么，但我不确定从哪里开始使用 matplotlib/seaborn。

我有大约 999行不相等的 0、1 和 2。这是一行的示例：

[1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 1, 1]

我想制作一个水平图，其中每个数字映射到某个设定单位长度的颜色。

这看起来像一个堆积条形图。但我相信 plt.bar 的功能会汇集值，使得只能有三种连续的颜色。但是我需要实现图表，以便颜色之间可以有任意数量的切换。

标签： pythonmatplotlibseaborndata-sciencebioinformatics

Answer 1

imshow如果您使用 1000 行而不是条形图将数据显示为图像，我想您会更好。将您的数据 (0或1)2放入一个 999 行和与最长序列一样多的列的数组中，使用 初始化该数组-1。

只有 100 行以提高可读性的示例：

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

# generate some sample data
n, m = 10, 20
a = np.random.randint(0, 3, (n,m))
s = np.random.randint(int(m/2), m, n)
for i in range(n):
    a[i,s[i]:] = -1

# show them as image
cmap = plt.matplotlib.colors.ListedColormap(['w', 'r', 'lime', 'b'])
plt.imshow(a, cmap=cmap)

然后，您可以根据需要调整轴刻度和标签。