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r - R在docker容器中没有调用包

问题描述

我有一个 docker 映像，我使用以下几行安装了几个软件包：

FROM rocker/verse:4.0.3
... (some other installation details)
RUN install2.r --error \
    glmnet \
    ineq
    ...

但是，在从该映像运行容器时，我偶尔会收到错误消息，其中 R 似乎找不到该包：

Error in library(ineq) : there is no package called 'ineq'

如果我创建容器的新版本并手动打开 R 并运行它，我将永远无法重现此错误。有谁知道我该如何解决这个问题（或者我应该寻找什么来重现这个问题）？

标签： rdockerinstallationpackage

解决方案

击中相同的“奇怪”行为..

我的解决方法是（我知道它不优雅）使用 pacman 而不是库行。如果 pacman 找不到它只是安装它的库，它会做什么。这显然是粗鲁和反容器模式，但在某些时候我们需要继续前进：-/.. 这里的一个很大缺点是，如果容器丢失所有包并开始重新安装，容器启动时间可能会很长他们

if(!require("pacman")) install.packages("pacman")
pacman::p_load("glmnet","ineq")

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