r - 带有 invalidateLater() 的简单闪亮应用程序错误地丢弃了持久后台进程

Question

我正在尝试编写一个最小的 Shiny 应用程序来维护一个持久的外部后台进程。由于特定于全尺寸用例的原因，我在文本文件中跟踪 PID 而不是仅使用processx句柄。当我启动应用程序时，它看起来像这样：

当我按下“开始”按钮时，应用程序会创建一个后台进程并将 PID 记录在一个文本文件中。invalidateLater()重复读取文本文件并显示 PID 和状态的反应上下文。

该过程应该运行，直到我单击“停止”。但在初始化后不到一秒钟，该进程自行退出。

如果我删除invalidateLater()，该过程将继续运行。或者，如果我使用processx句柄而不是ps文本文件，则该应用程序可以工作，但这对于我的用例来说还不够。

应用代码

library(callr)
library(ps)
library(shiny)
library(tools)

ui <- fluidPage(
  actionButton("start", "start"),
  actionButton("stop", "stop"),
  textOutput("status")
)

server <- function(input, output, session) {
  file <- tempfile()
  observeEvent(input$start, {
    px <- r_bg(function() Sys.sleep(Inf))
    writeLines(as.character(px$get_pid()), file)
  })
  observeEvent(input$stop, {
    pid <- as.integer(readLines(file))
    if (pid %in% ps_pids()) {
      ps_kill(ps_handle(pid))
    }
  })
  output$status <- renderText({
    invalidateLater(100)
    if (file.exists(file)) {
      pid <- as.integer(readLines(file))
      paste(ifelse(pid %in% ps_pids(), "running", "stopped"), pid)
    }
  })
}

shinyApp(ui = ui, server = server)

会话信息

R version 4.0.3 (2020-10-10)
Platform: x86_64-apple-darwin17.0 (64-bit)
Running under: macOS Catalina 10.15.7

Matrix products: default
BLAS:   /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libBLAS.dylib
LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/lib/libRlapack.dylib

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] tools     stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods  
[8] base     

other attached packages:
[1] shiny_1.6.0 ps_1.5.0    callr_3.5.1

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_1.0.6        magrittr_2.0.1    xtable_1.8-4      R6_2.5.0         
 [5] rlang_0.4.10      fastmap_1.1.0     jquerylib_0.1.3   htmltools_0.5.1.1
 [9] ellipsis_0.3.1    yaml_2.2.1        digest_0.6.27     lifecycle_1.0.0  
[13] processx_3.4.5    later_1.1.0.1     sass_0.3.1        promises_1.2.0.1 
[17] rsconnect_0.8.16  cachem_1.0.4      mime_0.10         compiler_4.0.3   
[21] bslib_0.2.4       jsonlite_1.7.2    httpuv_1.5.5   

编辑：垃圾收集

这是因为垃圾收集processx句柄。我可以用 2 个 R 会话来证明这一点。会话 1 创建一个后台进程。

px <- r_bg(function() Sys.sleep(Inf))
px$get_pid()
#> [1] 8252

会话 2 循环检查从会话 1 产生的后台进程。

library(ps)
while(TRUE) {
  print(8252 %in% ps_pids())
  Sys.sleep(1)
}

TRUE会话 2 从每秒打印一次开始。但是当我rm(px); gc()在会话 1 中调用时，会话 2 打印FALSE。

我现在看到垃圾收集的终止是一个故意的功能processx：https ://github.com/r-lib/processx#features 。我猜在大多数情况下都是合理的。

标签： rshinycallrprocessx

Answer 1

如果我设置cleanup为TRUEin ，该过程将继续进行callr::r_bg()。问题解决了。