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r-markdown - Rmarkdown：如果块中有错误，则继续编织

问题描述

我有一个 R Markdown 文件，我将其重新用于分析新样本。有时分析不会产生显着的结果，因此当我尝试绘制结果时会引发错误。如果发生此类错误，我只想继续编织 PDF。

我试过 {r error = TRUE}了，但由于某种原因，编织仍然停止。是否有另一个 knitr 选项可以绕过该错误？

{r Gene Ontology Enrichment, include = FALSE, error = TRUE}
enrichplot::barplot(ego.MF,
        font.size = 8,
        title="GO Enrichment - Molecular Function",
        showCategory=20)

Quitting from lines 441-478 (file.Rmd) 
Error in ans[ypos] <- rep(yes, length.out = len)[ypos] : 
  replacement has length zero

标签： r-markdown

解决方案

问题出在代码块的 knitr 选项中。显然使用include = FALSEwitherror = TRUE是不兼容的。

相反，我切换到： {r Gene Ontology Enrichment, echo = FALSE, error = TRUE}

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