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python - 带有 conda env 的 uWSGI 不断失败（Docker）

问题描述

我一直在尝试多种方法来使用 uWSGI 和 NGINX 部署带有 conda 包的 Flask API，但没有运气。

非常感谢任何帮助以使其正常工作。

在我目前的方法中，我使用 NGINX 基础映像，然后安装 python 包 conda，创建一个新的环境，其中包含 environment.yml 的库部分。然后在我的启动脚本中，我激活 conda env，启动 nginx 服务，然后是 uwsgi。

我看到发生的是，uWSGI 无法作为安装了软件包的 conda env 的一部分运行，并且由于导入而最终失败。但是，如果我从同一个地方运行 python main.py 它会在开发模式下正确启动。

uwsgi.ini

[uwsgi]
module = main:app
uid = root
gid = root
master = true
processes = 5

socket = /tmp/uwsgi.socket
chmod-sock = 664
vacuum = true
plugins    = http,python3

die-on-term = true

Dockerfile

FROM nginx
SHELL [ "/bin/bash", "--login", "-c" ]

RUN apt-get update \
    && apt-get install -yyq netcat && apt-get install -y sudo


RUN apt-get update && apt-get install -y \
    python3-pip python3-dev uwsgi-plugin-python3 \
    nginx supervisor curl git wget

RUN apt-get install -y libpq-dev

COPY environment.yml requirements.txt /tmp/

COPY postBuild.sh /usr/local/bin/postBuild.sh
RUN chmod u+x /usr/local/bin/postBuild.sh
COPY docker/entrypoint.sh /usr/local/bin/
RUN chmod u+x /usr/local/bin/entrypoint.sh

COPY app /usr/local/bin/app
COPY app/nginx.conf /etc/nginx

RUN chmod u+x /usr/local/bin/app/start.sh

ENV MINICONDA_VERSION latest
ENV CONDA_DIR $HOME/miniconda3
RUN wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-$MINICONDA_VERSION-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && \
    chmod +x ~/miniconda.sh && \
    ~/miniconda.sh -b -p $CONDA_DIR && \
    rm ~/miniconda.sh
ENV PATH=$CONDA_DIR/bin:$PATH
RUN echo ". $CONDA_DIR/etc/profile.d/conda.sh" >> ~/.profile

RUN conda init bash
ENV PROJECT_DIR $HOME/app
WORKDIR $PROJECT_DIR
ENV ENV_PREFIX $PWD/env

RUN conda update --name base --channel defaults conda && \
    conda env create --prefix $ENV_PREFIX --file /tmp/environment.yml --force && \
    conda clean --all --yes

WORKDIR /usr/local/bin/app/



RUN conda activate $ENV_PREFIX && \
    /usr/local/bin/postBuild.sh && \
    conda deactivate


CMD ["./start.sh"]

启动.sh

export PATH=/miniconda/bin:$PATH
echo ". /miniconda3/etc/profile.d/conda.sh" >> ~/.profile
conda init bash
eval "$(conda shell.bash hook)"
export PYTHONPATH=/env/bin/python
conda activate /env
service nginx start
uwsgi --ini uwsgi.ini

标签： pythonbashdockercondauwsgi

解决方案

问题是您正在安装两种不同版本的 Python：一种通过 apt-get（这是 uwsgi 想要的），另一种使用 Conda。

您应该将 uwsgi 安装为 conda 包，即将它列为您的 environment.yml 中的依赖项。它应该可以通过 conda-forge 获得：https ://anaconda.org/conda-forge/uwsgi

请参阅https://pythonspeed.com/articles/importerror-docker/了解 Python 程序何时无法运行或库无法导入的检查清单。

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