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input - MPI 读取简单的数据框或 txt 文件

问题描述

我有这个数据框：

date,AA,BB,CC
2018-01-01 00:00:00,45.73,0.0,1
2018-01-01 01:00:00,44.16,0.0,2
2018-01-01 02:00:00,42.24,0.0,3
2018-01-01 03:00:00,39.29,0.0,5
2018-01-01 04:00:00,36.0,0.0,6
2018-01-01 05:00:00,41.99,0.0,7
2018-01-01 06:00:00,42.25,0.0,8

我想是否可以使用 MPI I/O 范例来阅读它。

特别是，我想根据处理器的数量来划分行。假设你有 4 个处理器。我希望每个处理器读取两行：处理器 0，第 1,2 行；处理器 1，第 3,4 行；等等。

我研究了一些材料。据我所知，我必须做一种偏移并将文件写在一行中。另一种可能性是使用与子网格相关的东西。

但是，正如您所注意到的，每一行都有不同类型的变量。

你们有人可以给胶水吗？到目前为止，我发现的有关 MPI I/O 的内容非常理论化，没有实际示例。

谢谢，迭戈

标签： inputmpimpi-io

解决方案

MPI-IO 非常适合二进制数据。它不太适合文本数据。

如果这是二进制数据，我希望有一个标题和一个索引。Rank 0 可以读取该标头和索引，向数据所在的每个人广播，然后可能会发生一些记录的算法分解（例如，每个 rank 读取 N 条记录）

对于这样的 ascii 文件，您是对的：您如何拆分文件？

这些文件有多大？如果它们有几兆字节（所以不是那么大），读取 rank 0 上的数据并从那里分发

另一种方法可能是生成索引——数据帧的一部分或单独的二进制索引。该索引会将记录映射到文件偏移量，现在您可以将读取工作拆分到所有进程中。

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