首页 > 解决方案 > /usr/bin/zcat:参数列表太长

问题描述

我使用了以下这些命令的指南:

echo "accession\taccession.version\ttaxid\tgi" > reference_proteomes.taxid_map
zcat */*/*.idmapping.gz | grep "NCBI_TaxID" | awk '{print $1 "\t" $1 "\t" $3 "\t" 0}' >> reference_proteomes.taxid_map

我用echo "accession\taccession.version\ttaxid\tgi" > reference_proteomes.taxid_map&zcat *.idmapping.gz | grep "NCBI_TaxID" | awk '{print $1 "\t" $1 "\t" $3 "\t" 0}' >> reference_proteomes.taxid_map

但我收到参数列表太长的消息:/usr/bin/zcat: Argument list too long

所以我在这个中尝试了 xargs:find /Volumes/My\ Passport\ for\ Mac/uniprot | xargs zcat *.idmapping.gz | grep "NCBI_TaxID" | awk '{print $1 "\t" $1 "\t" $3 "\t" 0}' >> reference_proteomes.taxid_map 但仍然收到长列表参数消息-bash: /usr/bin/xargs: Argument list too long,有什么建议吗?

标签: xargszcat

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