python - SimpleITK 转换后的白点
问题描述
我正在使用 SimpleITK 执行和多次转换到 3d 扫描。转换完成后,我会得到白点(见下图)。希望有人可以帮助解释原因,也许可以帮助我摆脱这些文物。如果您需要更多信息,请与我们联系。
def resample(image, transform):
"""
This function resamples (updates) an image using a specified transform
:param image: The sitk image we are trying to transform
:param transform: An sitk transform (ex. resizing, rotation, etc.
:return: The transformed sitk image
"""
reference_image = image
interpolator = sitk.sitkBSpline
default_value = 0
return sitk.Resample(image, reference_image, transform, interpolator, default_value)
def get_center(img):
"""
This function returns the physical center point of a 3d sitk image
:param img: The sitk image we are trying to find the center of
:return: The physical center point of the image
"""
width, height, depth = img.GetSize()
return img.TransformIndexToPhysicalPoint((int(np.ceil(width/2)),
int(np.ceil(height/2)),
int(np.ceil(depth/2))))
translation = sitk.TranslationTransform(3, [x_trans,y_trans,z_trans])
image_center = get_center(brain_img)
euler_transform = sitk.Euler3DTransform(image_center, theta_x, theta_y, theta_z, (0, 0, 0))
euler_transform.SetCenter(image_center)
euler_transform.SetRotation(theta_x, theta_y, theta_z)
tx=sitk.CompositeTransform([euler_transform,translation])
resampled_image = resample(brain_img, tx)
右边是原图,左边是新图。
解决方案
推荐阅读
- r - 如何以 10000 次重复优化 r 中的分层随机抽样
- python - python在写入文件时在行之间创建空行
- javascript - 为什么 console.log 的行为与 .innerText/.innerHTML 属性不同
- opencv - 如何使用 cv2.grabcut 改进前景提取
- javascript - 使用 mongodb 在 nodejs 上对用户的参与者进行分组
- angularjs - 接受指定状态 URL 之后的任何后续字符
- javascript - Promise.all() 用于 promiseArray 不返回任何值
- javascript - 柏树 | SyntaxError: Unexpected token, expected "," 解析文件时:
- firebase - 为什么它不让用户保持登录状态
- php - 只有一个特殊字符 (à) 在 UTF-8 中未正确显示