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r - glmmTMB 'giveCsparse' 的每个模型中的警告

问题描述

我正在使用 glmmTMB 库在 R 降价文档中运行混合模型。我运行的任何模型都会收到以下警告：

'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you

然后，如果我在控制台中运行代码，我会收到以下警告：

Warning messages:
1: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0),  :
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
2: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0),  :
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
3: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0, 0), i = integer(0), j = integer(0),  :
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you

我的代码如下所示：

m1 <- glmmTMB(count~var1+var2+var3+(1|group), data = bd, family = "poisson")

我尝试使用 重新安装 TMB 和 glmmTMB dependencies=TRUE，但消息不断出现。显然它根本不会影响模型，但无论我做什么测试或图表，我都会不断收到警告。有可能解决这个问题吗？或者我只是忽略它？

标签： rwarningsglmmtmb

解决方案

它是无害的。你可以：

  1. 从 CRAN安装最新版本glmmTMB（目前为 1.1.2）。
  2. 忽略它
  3. 使用suppressWarnings()（可能会错过其他相关警告！）
  4. 从 GitHub 安装开发版本，该版本已在此提交中修复。（存储库中的二进制包现在也已更新。）

或者您可以将您的版本降级Matrix为旧版本（使用remotes::install_version()或snapshot包）

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