sequencing - 如何在 MuSE 调用中将选项“-r”或“-l”与 WGS 数据一起使用？

Question

有人用 WGS 数据尝试过 MuSE 调用选项“-r”或“-l”吗？

https://bioinformatics.mdanderson.org/public-software/muse/

为了加快“MuSE 调用”，我们建议使用提供的选项“-r”或“-l”将 WGS 数据分成小块（<50Mb），并通过 Linux 命令 CAT 连接所有输出文件。

MuSE 建议使用提供的选项“-r”或“-l”将 WGS 数据拆分为小块。所以我尝试使用“-r”或“-l”选项，但存在错误提示

call: option requires an argument -- 'r'

或者

[main] unrecognized command '-r'
Either tumor sample ID is missing or multiple tumor sample IDs are found. Please check input file.

好像他们没有拆分选项...

如果是这样，我如何以不同的方式将 WGS 数据拆分为小块？

标签： sequencing