r - 使用 network_plot 在 R 中可视化相关矩阵

Question

我想可视化 60 多个属性的相关矩阵。我试过'library(corrplot)'，结果显示警告：“重叠太多”。然后我尝试了，它显示了标签太大并且曲线重叠的混乱图。

library(corrr)
data %>% correlate() %>% network_plot(min_cor = 0.4)

我尝试按照https://www.rdocumentation.org/packages/memnet/versions/0.1.0/topics/network_plot调整标签大小和曲线宽度，它显示错误：

network_plot 中的错误（相关（数据），min_cor = 0.4，nod_cex = 2，：未使用的参数（nod_cex = 2，lab_cex = 1，lab_lwd = 2）

标签： rnetworkingvisualizationcorrelation

Answer 1

memnet是已从 CRAN 中删除的已弃用包，因此这是正常的，您不能使用network_plot此包中的，但在这里您使用的network_plot是包中的函数，但corrr参数不同：https://www.rdocumentation。 org/packages/corrr/versions/0.4.3/topics/network_plot

有 60 个变量，我不认为network_plot是可视化的最佳选择。但是，您可以尝试corrplot如下使用：

#Create a data frame with random values
df=data.frame(replicate(60,sample(0:60,10,rep=TRUE)))
cor=cor(df)
cor2 <- corrplot::corrMatOrder(cor, order = "FPC", hclust.method = "average")
corrplot::corrplot(cor[cor2,cor2], diag = F, type = "lower",
                       method = "color",  mar = c(1,1,3,1), tl.srt = 60, tl.cex = 0.4)

这将产生这个更易于解释的图表：