r - 如果我的性状 X 不能通过体型回归,我如何挽救由系统发育和 SE 校正的残差?
问题描述
我的问题遵循这个简洁的介绍:
我有一个数据框,包括:物种、性状 X 值(平均值)和每个物种的性状 X 的 SE;以及物种分支长度的系统发育。
我想知道是否有可能通过系统发育关系和SE创建“正确”的特征X分布的残差?
我的理由是这样一个事实,即当特征 X 回归时,例如通过体型回归,它可能创建包括 SE 和系统发育关系的残差,因此使用类似的东西:
使用来自nlme的gls:
gls(trait X ~ body size, correlation=corPagel(1, phy=tree),
data=data, method = "ML", weights= SE)
在哪里SE <- varFixed (~1/sqrt(traiX_SE))
但是,如果我的性状 X 不能通过体型回归,我如何挽救由系统发育关系和 SE 校正的残差?是否有意义?
提前致谢!
解决方案
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