r - RColorBrewer::brewer.pal(n, pal) 中的错误：NA 不是 brewer.pal 的有效调色板名称

Question

我正在尝试在 pheatmap 中注释数据点。在绘制热图之前一切正常。

data <- as.matrix(Round_1)                                                            
library(pheatmap)                                                                       
df = data.frame(Annotation)                                                               
colnames(df) = colnames(data)                                                             
pheatmap(data, cluster_rows = FALSE, cellwidth = 10, cellheight = 12,annotation_col = df)`    

对于最后一行，我收到一个错误：Error in RColorBrewer::brewer.pal(n, pal) : NA is not a valid palette name for brewer.pal

我什至没有使用 RColorBrewer 包，也没有指定任何颜色。如果我使用 RColorBrewer 库并指定注释颜色，则会收到以下错误：

    Error in annotation_colors[[names(annotation)[i]]] <- brewer_pal("seq",  : 
  more elements supplied than there are to replace

至于独立的列注释，我有3个集群；每个数据点都应该属于一个。

标签： rpheatmap