python - 用 pvalues 标记热图

Question

我有一个来自我运行的一组回归模型和相关 p 值的 beta 系数矩阵。我想制作一个带有星号或星号的 Beta valeus 热图，这些值具有显着性。最好是两颗星，一颗用于划分bonferonni 阈值，另一颗用于划分FDR。如何用符号或其他方式注释 heatmap.2 中的值？我也很乐意接受 seaborn 解决方案。

#example of betas
> bees[1:3, 1:3]
                    smri_thick_cdk_banksstslh smri_thick_cdk_cdacatelh smri_thick_cdk_cdmdfrlh
Height                             0.61403585                0.9574614               0.8578689
Weight                             0.07517904                0.6418907               0.2238402
Waist Circumference                0.07336446                0.4155540               0.1593594

#sample of p-values
> peas[1:3, 1:3]
                    smri_thick_cdk_banksstslh smri_thick_cdk_cdacatelh smri_thick_cdk_cdmdfrlh
Height                             0.61403585                0.9574614               0.8578689
Weight                             0.07517904                0.6418907               0.2238402
Waist Circumference                0.07336446                0.4155540               0.1593594

#example heatmap
heatmap.2( x=as.matrix(bees[1:3, 1:3]),
           dendrogram="none",
           keysize = 1,
           key.title = NA,
           key.ylab = NA,
           density.info = "none",
           trace = "none",
           Colv = "Rowv",
           scale = "none",
           main = "betas")

标签： pythonrseabornvisualizationheatmap