首页 > 解决方案 > 如何在 R 中获取 Seurat 对象的集群级别

问题描述

我想从 Seurat 对象中生成的所有集群中获取随机集群样本。我创建了一个名为胶质母细胞瘤的 Seurat 对象。进行聚类后,我得到了 10 个聚类,级别为 0,1,..., 9。假设我有 1000 个细胞。当我检查 Idents(glioblastoma) 或 glioblastoma@active.ident (我也检查了胶质母细胞瘤的元数据)时,它将显示每个单元格以及每个集群级别的信息,例如单元格 1 集群 0,单元格 2 集群 3,等等。因此,length(Idents(glioblastoma)) = 1000 而不是 10。如何检索此信息以仅获取集群级别?因此,我可以使用样本(簇数,1)?我不想直接或手动制作它,例如 sample(0:9, 1) 虽然我知道集群级别是 0, 1, ..., 9,

标签: rmetadatacluster-analysis

解决方案


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