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r - 如何从当前运行的 R 脚本的上下文中获取绝对路径？

问题描述

使用 python，如果我需要当前运行脚本的上下文中的绝对路径，我需要做的就是在该脚本的代码中添加以下内容：

import os
os.path.abspath(__file__)

这非常有用，因为我可以使用os.path.join绝对路径为我的项目组件（在项目目录树内）形成新的绝对路径，更有趣的是，无论包目录移动到哪里，一切都将继续工作而没有任何问题.

我需要使用 R 编程实现同样的目的，即获取当前正在运行的 R 脚本的绝对路径（= 其文件在磁盘上的绝对路径）。但是尝试在 R 中做同样的事情被证明是相当具有挑战性的，至少对我作为 R 的初学者来说是这样。

经过大量谷歌搜索后，我尝试使用 reticulate 包从 R 调用 Python，但__file__在那里不可用，然后我发现 Stackoverflow 上的一些线程建议使用正在运行的 Stack 和其他建议使用normalizePath. 但是，当整个项目包从一个目录转移到另一个目录时，这些都不适合我。

因此，我想知道例如您是否有以下文件/目录树

base_dir ( = /home/usr1/apps/R/base_dir)
|
|
|___ myscript.R (this is my R script to be run)
|___ data (this is a directory)
|___ sql  (this is a directory)

是否有任何解决方案允许在代码中添加一些内容，myscript.R以便在脚本中程序始终可以知道基本目录是/home/usr1/apps/R/base_dir，如果稍后将此基本目录移动到另一个目录，则无需更改代码和程序能够正确找到新的基本目录吗？

标签： r

解决方案

R 通常无法找到这条路径，因为__file__在 R中没有与 Python 等效的路径。

您可以获得的最接近的方法是查看commandArgs()并费力地提取脚本文件名（这需要根据脚本的启动方式进行不同的处理！）。但是如果脚本是在 RStudio 中执行的，这将失败，并且在调用setwd().

其他解决方案（例如“here”包）依赖于启发式方法和特定的项目结构。

但幸运的是，实际上有一个始终有效的解决方案：使用'box' modules。

使用模块，您将始终能够通过box::file(). 这是你在 R 中得到的最接近 Python 的等价物__file__，而且它总是有效的——只要你始终使用“盒子”模块。

（在内部，'box'包需要复杂的逻辑来确定file()函数在所有情况下的值；我不建议复制它，它太复杂了。对于好奇，大部分相关逻辑都在R/loaded.r。）

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