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r - 气泡图未显示元包 R 中的所有点

问题描述

我是编码新手，所以我希望我提供所有必要的信息来回答这个问题！我正在使用 R 中的 meta 包进行元回归，并使用气泡函数对其进行绘图。我有 173 个点要绘制，但是，它只在图表上显示我的数据集中的 2 个点，我不知道为什么。

它说：

In bubble.metareg(m.gen.reg, studlab = TRUE, :
  Only first covariate in meta-regression ('population_density') considered in bubble plot. No regression line plotted.

我不确定这意味着什么，也没有找到显示我所有观点的方法。如果您知道该消息的含义或如何解决它，我将不胜感激。

当前正在生成的图形图像

这是我的代码：

library(tidyverse)
library(dplyr)
library(meta)
library(stringr)
library(tidyr)

#took my large dataset and made it smaller to work with

small_dataset_2 <- read.csv("FirstRegressionData.csv",stringsAsFactors = F) %>%
  select(Author,Location,Date,value,Lower_Confidence_Limits, Upper_Confidence_Limits,Density_km2) %>%
  mutate(Stand_err =((Upper_Confidence_Limits - value)/1.96)) %>%
  na.omit("small_dataset_2")

#object used for meta analysis

m.gen <- metagen (TE = small_dataset$value,
                  seTE = Stand_err,
                  studlab = Location,
                  data = small_dataset,
                  comb.fixed = FALSE,
                  comb.random = TRUE,
                  overall.hetstat = TRUE,
                  method.tau = "REML")


population_density <- small_dataset_2$Density_km2
                  
m.gen.reg <- metareg(m.gen, ~population_density)  
m.gen.reg

bubble(m.gen.reg, 
       studlab = TRUE,
       xlim = c(1,500),
       ylim = c(0,18),
       regline = TRUE,
       xlab = ("x-axis"),
       ylab = ("y-axis"),
       col.line = "blue"
       )

谢谢！

标签： rregressionmetabubble-chart

解决方案

欢迎！关于您正在使用的气泡功能的元包状态说明（说明中的bubble.metareg）：

它是一个散点图，每项研究的治疗效果位于 y 轴上，并且是元回归中使用的协变量。

我强调了表示只识别了一个协变量。所以我的猜测是metareg没有为bubble生成预期的对象。

当您打印 m.gen.reg 时，它是否类似于在 R 在线书籍中进行元分析的第 8.2 节中的以下内容？ 在此处输入图像描述

此外，metagen用于small_dataset，它没有在任何地方定义。我反而看到了 small_dataset_2。

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