r - R Roxygen:在示例中没有找到导入的函数
问题描述
在我正在编写的一个包的函数中,我想从公式和数据创建一个 cox ph 模型。没什么了不起的,并且该功能按预期工作。在内部,我调用该coxph
函数,该函数又调用该Surv
函数(均来自生存包)。
向 roxygen 标头添加示例时,我在测试时收到以下错误消息:
Surv 中的错误(时间、状态):找不到函数“Surv”
在 roxygen 标头中,我已经声明了导入(仅使用函数,但也尝试了整个包),并且 NAMESPACE 文件清楚地列出了导入。将包加载到干净的工作区(没有加载生存)时,该功能也可以工作(如果我删除导入则不起作用)。
如何确保示例具有正确的可用命名空间?我讨厌使用\dontrun
.
缩写函数(不打算运行,语法不正确,只是上下文发生的事情的简化版本):
#' @importFrom survival coxph Surv
build_cox_model <- function(params) {
cox_form <- basecamb::build_model_formula(params)
cox_model <- survival::coxph(data, cox_form)
}
扩展错误信息:
data <- survival::lung
build_cox_model(data, 'time', 'status', c('age','sex'))
Error in Surv(time, status) : could not find function "Surv"
Calls: build_cox_model ... eval -> <Anonymous> -> model.frame.default -> eval -> eval
Execution halted
解决方案
推荐阅读
- android - 按钮下拉列表
- vba - Word-VBA-为什么我会收到运行时错误 451“未定义属性让过程且属性获取过程未返回对象”?
- angular - 无法为 Angular 9 应用程序构建 Docker 映像
- javascript - 如何使用循环压缩 JavaScript
- c# - 如何调用具有多个参数的 POST 方法?
- symfony - Symfony yaml 配置:执行纯 php 代码
- button - 创建几个进行 REST API 调用的按钮
- r - 计算可能包含 NA / 缺失值的列值的组合(不是排列)
- python - 有没有办法在 cpanel 上部署 fastapi 应用程序?
- angular - 如何在角度 8 的同一页面中保持任何点击的滚动位置