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r - glm.cluster 对象的伪 R 平方

问题描述

我使用Rglm.cluster()中的miceadds包中的函数估计了几个具有集群鲁棒标准错误的 glms。

不幸的是，该函数不会自动计算伪 R 平方。此外，我无法找到一个包来计算与glm.cluster. 到目前为止，我已经尝试过rcompanion's nagelkerke()，fmsb'sNagelkerkeR2()甚至psfmi's rsq_nagel()。

以前有没有其他人遇到过这个问题，你知道如何在不编写自己的函数的情况下解决它吗？

标签： rlogistic-regressionglmcoefficient-of-determination

解决方案

glm.cluster返回一个二元素列表，其中的第一个元素（称为$glm_res）是实际glm拟合。我使用performance::r2_nagelkerke()它是因为那是我得心应手的，但是如果您将它应用于$glm_res组件，任何 Nagelkerke R2 功能都可能会起作用。

设置示例：

data(data.ma01, package = "miceadds")
dat <- data.ma01
dat$highmath <- 1 * ( dat$math > 600 )   # create dummy variable
mod2 <- miceadds::glm.cluster( data=dat, formula=highmath ~ hisei + female,
                     cluster="idschool", family="binomial")

library(performance)
r2_nagelkerke(mod2$glm_res)
## Nagelkerke's R2 
## 0.05126081

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