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bash - 如何使用 ncatted 添加或编辑大量全局属性？

问题描述

是否有使用ncatted编辑和/或添加大量全局属性的便捷方法？也许通过将每个att_dsc指定到外部文件并将其作为参数传递？

编辑：我不工作的解决方案是：ncatted -h $(cat global_attributes | xargs -d '\n') file.in file.out

而在global_attributes我有一个att_dsc列表如下：

-a institution,global,m,c,"Super Cool University"
-a source,global,c,c,"My Awesome Radar"
-a contributors,global,c,c,"Enrico Fermi, Galileo Galilei, Leonardo Da Vinci"

这里的问题似乎是包含多个单词的字符串的引号！

标签： bashnetcdfnco

解决方案

ncatted支持两种互补的大规模属性修改方法：正则表达式和多选项。适合正则表达式的所有变量都可以同时修改其属性，并且-a aed_sct每次调用可以多次使用该选项：

ncatted -a units,temperature.?,o,c,kelvin -a foo,bar,o,c,davegrohl in.nc out.nc

这都记录在这里。

编辑：刚刚注意到 OP 想要全局属性。有一个 NCO 范围的选项 --glb_att_add 在这里可能做得很好，因为这些选项可以用冒号分隔。记录在这里。

ncks --glb machine=${HOSTNAME}:created_by=${USER}:... in.nc out.nc

编辑 20210907：刚刚注意到您巧妙地使用了xargs. 你离解决这个问题太近了！尝试在输入文件中的每个双引号前加上反斜杠，例如，\"foo bar\"这应该保持引号完整，以便 shell 正确传递参数。

编辑 20210910：正如下面的评论中提到的，直接在命令行上直接替换 xargs 的结果是行不通的（为什么？）。但是，一个简单的解决方法是使用xargs构造命令字符串，并使用 执行该字符串eval，如下所示：

cat > opt.txt << EOF
-a institution,global,o,c,\'Super Cool University\'
-a source,global,o,c,\'My Awesome Radar\'
-a contributors,global,o,c,\'Enrico Fermi, Galileo Galilei, Leonardo Da Vinci\'
EOF

opt=$(cat opt.txt | xargs)
cmd="ncatted -O ${opt} in.nc out.nc"
eval $cmd

请注意使用反斜杠来保护选项文件中的引号不受 shell 影响。此外，GNU 的xargs行为与 MacOS 不同，因此应小心为其制定任何参数。尽管如此，上述程序对我有用。

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