variant - 如何用特定突变标记系统发育树的分支?
问题描述
我想生成一个细菌种群 [MRSA] 的系统发育树,它可以描述/注释该种群每个分支的突变。我能够生成系统发育树,但无法分配可以定义每个分支的特定突变。我遇到了一个名为“NextClade”的网站,它可以生成我们想要的确切图表,但它仅适用于病毒。我正在尝试寻找其他工具,这些工具也可以为其他物种生成带有所需注释的树。
您可以通过在站点中运行示例来查看树。Nextclade 网站:https ://clades.nextstrain.org/results
- 您可以单击运行示例
- 查看比较图
- 单击右上角的树选项。
- 我们可以单击每个单独的分支并查看导致该分支的突变。
解决方案
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